Protein–RNA interactions for Protein: Q96FF7

MISP3, Uncharacterized protein MISP3, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MISP3Q96FF7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MISP3Q96FF7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
MISP3Q96FF7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MISP3Q96FF7 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
MISP3Q96FF7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MISP3Q96FF7 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MISP3Q96FF7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MISP3Q96FF7 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
MISP3Q96FF7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
MISP3Q96FF7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
MISP3Q96FF7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms