Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJA3Q96EY1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DNAJA3Q96EY1 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJA3Q96EY1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJA3Q96EY1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJA3Q96EY1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJA3Q96EY1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
DNAJA3Q96EY1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJA3Q96EY1 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJA3Q96EY1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJA3Q96EY1 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJA3Q96EY1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DNAJA3Q96EY1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJA3Q96EY1 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJA3Q96EY1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJA3Q96EY1 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJA3Q96EY1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJA3Q96EY1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJA3Q96EY1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJA3Q96EY1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJA3Q96EY1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJA3Q96EY1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJA3Q96EY1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJA3Q96EY1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJA3Q96EY1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJA3Q96EY1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJA3Q96EY1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJA3Q96EY1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJA3Q96EY1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJA3Q96EY1 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJA3Q96EY1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJA3Q96EY1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJA3Q96EY1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJA3Q96EY1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJA3Q96EY1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJA3Q96EY1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJA3Q96EY1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJA3Q96EY1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJA3Q96EY1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJA3Q96EY1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJA3Q96EY1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJA3Q96EY1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJA3Q96EY1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJA3Q96EY1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJA3Q96EY1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJA3Q96EY1 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
DNAJA3Q96EY1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAJA3Q96EY1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAJA3Q96EY1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAJA3Q96EY1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAJA3Q96EY1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAJA3Q96EY1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAJA3Q96EY1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAJA3Q96EY1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAJA3Q96EY1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAJA3Q96EY1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJA3Q96EY1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJA3Q96EY1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJA3Q96EY1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJA3Q96EY1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJA3Q96EY1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJA3Q96EY1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJA3Q96EY1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJA3Q96EY1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJA3Q96EY1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJA3Q96EY1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJA3Q96EY1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJA3Q96EY1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJA3Q96EY1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJA3Q96EY1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJA3Q96EY1 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJA3Q96EY1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJA3Q96EY1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJA3Q96EY1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJA3Q96EY1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJA3Q96EY1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJA3Q96EY1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJA3Q96EY1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJA3Q96EY1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJA3Q96EY1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJA3Q96EY1 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJA3Q96EY1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAJA3Q96EY1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAJA3Q96EY1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJA3Q96EY1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJA3Q96EY1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJA3Q96EY1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJA3Q96EY1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJA3Q96EY1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJA3Q96EY1 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJA3Q96EY1 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJA3Q96EY1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJA3Q96EY1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJA3Q96EY1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJA3Q96EY1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJA3Q96EY1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJA3Q96EY1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJA3Q96EY1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJA3Q96EY1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJA3Q96EY1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms