Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CCDC51Q96ER9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CCDC51Q96ER9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC51Q96ER9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CCDC51Q96ER9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC51Q96ER9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC51Q96ER9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CCDC51Q96ER9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC51Q96ER9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC51Q96ER9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CCDC51Q96ER9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC51Q96ER9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC51Q96ER9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CCDC51Q96ER9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC51Q96ER9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC51Q96ER9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC51Q96ER9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CCDC51Q96ER9 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CCDC51Q96ER9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CCDC51Q96ER9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CCDC51Q96ER9 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC51Q96ER9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CCDC51Q96ER9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC51Q96ER9 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC51Q96ER9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CCDC51Q96ER9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC51Q96ER9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC51Q96ER9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC51Q96ER9 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CCDC51Q96ER9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CCDC51Q96ER9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CCDC51Q96ER9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
CCDC51Q96ER9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC51Q96ER9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC51Q96ER9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC51Q96ER9 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CCDC51Q96ER9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms