Protein–RNA interactions for Protein: Q96CK0

ZNF653, Zinc finger protein 653, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF653Q96CK0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF653Q96CK0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF653Q96CK0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF653Q96CK0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF653Q96CK0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF653Q96CK0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF653Q96CK0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF653Q96CK0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF653Q96CK0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF653Q96CK0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF653Q96CK0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
ZNF653Q96CK0 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF653Q96CK0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF653Q96CK0 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF653Q96CK0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF653Q96CK0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF653Q96CK0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF653Q96CK0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF653Q96CK0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF653Q96CK0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF653Q96CK0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF653Q96CK0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF653Q96CK0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF653Q96CK0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF653Q96CK0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
ZNF653Q96CK0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF653Q96CK0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
ZNF653Q96CK0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF653Q96CK0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF653Q96CK0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF653Q96CK0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
ZNF653Q96CK0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
ZNF653Q96CK0 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF653Q96CK0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF653Q96CK0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF653Q96CK0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF653Q96CK0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF653Q96CK0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF653Q96CK0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
ZNF653Q96CK0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF653Q96CK0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF653Q96CK0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF653Q96CK0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
ZNF653Q96CK0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF653Q96CK0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF653Q96CK0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF653Q96CK0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF653Q96CK0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF653Q96CK0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
ZNF653Q96CK0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF653Q96CK0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF653Q96CK0 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF653Q96CK0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
ZNF653Q96CK0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF653Q96CK0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF653Q96CK0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF653Q96CK0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF653Q96CK0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
ZNF653Q96CK0 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF653Q96CK0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF653Q96CK0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF653Q96CK0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF653Q96CK0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF653Q96CK0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF653Q96CK0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
ZNF653Q96CK0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF653Q96CK0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF653Q96CK0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ZNF653Q96CK0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF653Q96CK0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF653Q96CK0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF653Q96CK0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF653Q96CK0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF653Q96CK0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF653Q96CK0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF653Q96CK0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF653Q96CK0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ZNF653Q96CK0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF653Q96CK0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF653Q96CK0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ZNF653Q96CK0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF653Q96CK0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF653Q96CK0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ZNF653Q96CK0 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF653Q96CK0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF653Q96CK0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF653Q96CK0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF653Q96CK0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ZNF653Q96CK0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF653Q96CK0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF653Q96CK0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF653Q96CK0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ZNF653Q96CK0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF653Q96CK0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF653Q96CK0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ZNF653Q96CK0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF653Q96CK0 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF653Q96CK0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ZNF653Q96CK0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ZNF653Q96CK0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms