Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMIGD2Q96BF3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMIGD2Q96BF3 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMIGD2Q96BF3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMIGD2Q96BF3 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMIGD2Q96BF3 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TMIGD2Q96BF3 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMIGD2Q96BF3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMIGD2Q96BF3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMIGD2Q96BF3 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMIGD2Q96BF3 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMIGD2Q96BF3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
TMIGD2Q96BF3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMIGD2Q96BF3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMIGD2Q96BF3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMIGD2Q96BF3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMIGD2Q96BF3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
TMIGD2Q96BF3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
TMIGD2Q96BF3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMIGD2Q96BF3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMIGD2Q96BF3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMIGD2Q96BF3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
TMIGD2Q96BF3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMIGD2Q96BF3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMIGD2Q96BF3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
TMIGD2Q96BF3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMIGD2Q96BF3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMIGD2Q96BF3 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMIGD2Q96BF3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TMIGD2Q96BF3 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TMIGD2Q96BF3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMIGD2Q96BF3 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMIGD2Q96BF3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TMIGD2Q96BF3 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMIGD2Q96BF3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMIGD2Q96BF3 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMIGD2Q96BF3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMIGD2Q96BF3 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMIGD2Q96BF3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TMIGD2Q96BF3 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMIGD2Q96BF3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TMIGD2Q96BF3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMIGD2Q96BF3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TMIGD2Q96BF3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMIGD2Q96BF3 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TMIGD2Q96BF3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMIGD2Q96BF3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMIGD2Q96BF3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMIGD2Q96BF3 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMIGD2Q96BF3 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMIGD2Q96BF3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TMIGD2Q96BF3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMIGD2Q96BF3 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMIGD2Q96BF3 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMIGD2Q96BF3 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMIGD2Q96BF3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TMIGD2Q96BF3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMIGD2Q96BF3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMIGD2Q96BF3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMIGD2Q96BF3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMIGD2Q96BF3 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMIGD2Q96BF3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMIGD2Q96BF3 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMIGD2Q96BF3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
TMIGD2Q96BF3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMIGD2Q96BF3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMIGD2Q96BF3 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMIGD2Q96BF3 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TMIGD2Q96BF3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMIGD2Q96BF3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMIGD2Q96BF3 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMIGD2Q96BF3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMIGD2Q96BF3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMIGD2Q96BF3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TMIGD2Q96BF3 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMIGD2Q96BF3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMIGD2Q96BF3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMIGD2Q96BF3 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMIGD2Q96BF3 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TMIGD2Q96BF3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMIGD2Q96BF3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMIGD2Q96BF3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TMIGD2Q96BF3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMIGD2Q96BF3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMIGD2Q96BF3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMIGD2Q96BF3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMIGD2Q96BF3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMIGD2Q96BF3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TMIGD2Q96BF3 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TMIGD2Q96BF3 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMIGD2Q96BF3 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMIGD2Q96BF3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TMIGD2Q96BF3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMIGD2Q96BF3 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMIGD2Q96BF3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMIGD2Q96BF3 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMIGD2Q96BF3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMIGD2Q96BF3 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMIGD2Q96BF3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TMIGD2Q96BF3 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms