Protein–RNA interactions for Protein: Q969M3

YIPF5, Protein YIPF5, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YIPF5Q969M3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF5Q969M3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF5Q969M3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
YIPF5Q969M3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
YIPF5Q969M3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF5Q969M3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF5Q969M3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF5Q969M3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF5Q969M3 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
YIPF5Q969M3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF5Q969M3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF5Q969M3 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
YIPF5Q969M3 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YIPF5Q969M3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YIPF5Q969M3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YIPF5Q969M3 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YIPF5Q969M3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YIPF5Q969M3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
YIPF5Q969M3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
YIPF5Q969M3 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
YIPF5Q969M3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
YIPF5Q969M3 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
YIPF5Q969M3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
YIPF5Q969M3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YIPF5Q969M3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
YIPF5Q969M3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
YIPF5Q969M3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
YIPF5Q969M3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF5Q969M3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF5Q969M3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF5Q969M3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF5Q969M3 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
YIPF5Q969M3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YIPF5Q969M3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YIPF5Q969M3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YIPF5Q969M3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YIPF5Q969M3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YIPF5Q969M3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YIPF5Q969M3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
YIPF5Q969M3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YIPF5Q969M3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
YIPF5Q969M3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YIPF5Q969M3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
YIPF5Q969M3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YIPF5Q969M3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YIPF5Q969M3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
YIPF5Q969M3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YIPF5Q969M3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YIPF5Q969M3 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YIPF5Q969M3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YIPF5Q969M3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
YIPF5Q969M3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
YIPF5Q969M3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YIPF5Q969M3 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YIPF5Q969M3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
YIPF5Q969M3 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
YIPF5Q969M3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YIPF5Q969M3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
YIPF5Q969M3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YIPF5Q969M3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YIPF5Q969M3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YIPF5Q969M3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YIPF5Q969M3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
YIPF5Q969M3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YIPF5Q969M3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YIPF5Q969M3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
YIPF5Q969M3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
YIPF5Q969M3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF5Q969M3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF5Q969M3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF5Q969M3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
YIPF5Q969M3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF5Q969M3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF5Q969M3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF5Q969M3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF5Q969M3 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF5Q969M3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
YIPF5Q969M3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YIPF5Q969M3 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YIPF5Q969M3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YIPF5Q969M3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
YIPF5Q969M3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
YIPF5Q969M3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF5Q969M3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF5Q969M3 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF5Q969M3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF5Q969M3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
YIPF5Q969M3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF5Q969M3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF5Q969M3 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF5Q969M3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF5Q969M3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
YIPF5Q969M3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YIPF5Q969M3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
YIPF5Q969M3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YIPF5Q969M3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YIPF5Q969M3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YIPF5Q969M3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
YIPF5Q969M3 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
YIPF5Q969M3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms