Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCE1Q969G3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCE1Q969G3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCE1Q969G3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCE1Q969G3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCE1Q969G3 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SMARCE1Q969G3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCE1Q969G3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCE1Q969G3 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCE1Q969G3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SMARCE1Q969G3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCE1Q969G3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCE1Q969G3 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCE1Q969G3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SMARCE1Q969G3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMARCE1Q969G3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMARCE1Q969G3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SMARCE1Q969G3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCE1Q969G3 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCE1Q969G3 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SMARCE1Q969G3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCE1Q969G3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCE1Q969G3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCE1Q969G3 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCE1Q969G3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCE1Q969G3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SMARCE1Q969G3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCE1Q969G3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCE1Q969G3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SMARCE1Q969G3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCE1Q969G3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCE1Q969G3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCE1Q969G3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCE1Q969G3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SMARCE1Q969G3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SMARCE1Q969G3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCE1Q969G3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCE1Q969G3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SMARCE1Q969G3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCE1Q969G3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCE1Q969G3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCE1Q969G3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCE1Q969G3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SMARCE1Q969G3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
SMARCE1Q969G3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCE1Q969G3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCE1Q969G3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCE1Q969G3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SMARCE1Q969G3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCE1Q969G3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCE1Q969G3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCE1Q969G3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SMARCE1Q969G3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SMARCE1Q969G3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCE1Q969G3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCE1Q969G3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
SMARCE1Q969G3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCE1Q969G3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
SMARCE1Q969G3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCE1Q969G3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCE1Q969G3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCE1Q969G3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
SMARCE1Q969G3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCE1Q969G3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
SMARCE1Q969G3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCE1Q969G3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SMARCE1Q969G3 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCE1Q969G3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCE1Q969G3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCE1Q969G3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCE1Q969G3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
SMARCE1Q969G3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCE1Q969G3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCE1Q969G3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
SMARCE1Q969G3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCE1Q969G3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCE1Q969G3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SMARCE1Q969G3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SMARCE1Q969G3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SMARCE1Q969G3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCE1Q969G3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCE1Q969G3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCE1Q969G3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SMARCE1Q969G3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCE1Q969G3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCE1Q969G3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCE1Q969G3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCE1Q969G3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SMARCE1Q969G3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCE1Q969G3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCE1Q969G3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
SMARCE1Q969G3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCE1Q969G3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCE1Q969G3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCE1Q969G3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SMARCE1Q969G3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCE1Q969G3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCE1Q969G3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCE1Q969G3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SMARCE1Q969G3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms