Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
FRAT1Q92837 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
FRAT1Q92837 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
FRAT1Q92837 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
FRAT1Q92837 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.64■■■□□ 2.82
FRAT1Q92837 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
FRAT1Q92837 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
FRAT1Q92837 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC32.63■■■□□ 2.81
FRAT1Q92837 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
FRAT1Q92837 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
FRAT1Q92837 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
FRAT1Q92837 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FRAT1Q92837 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
FRAT1Q92837 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FRAT1Q92837 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FRAT1Q92837 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FRAT1Q92837 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FRAT1Q92837 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
FRAT1Q92837 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
FRAT1Q92837 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
FRAT1Q92837 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
FRAT1Q92837 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
FRAT1Q92837 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
FRAT1Q92837 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
FRAT1Q92837 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
FRAT1Q92837 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
FRAT1Q92837 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
FRAT1Q92837 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
FRAT1Q92837 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.57■■■□□ 2.8
FRAT1Q92837 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
FRAT1Q92837 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
FRAT1Q92837 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FRAT1Q92837 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FRAT1Q92837 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
FRAT1Q92837 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
FRAT1Q92837 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
FRAT1Q92837 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
FRAT1Q92837 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
FRAT1Q92837 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
FRAT1Q92837 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
FRAT1Q92837 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
FRAT1Q92837 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
FRAT1Q92837 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
FRAT1Q92837 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
FRAT1Q92837 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
FRAT1Q92837 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
FRAT1Q92837 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
FRAT1Q92837 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
FRAT1Q92837 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
FRAT1Q92837 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
FRAT1Q92837 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
FRAT1Q92837 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.5■■■□□ 2.79
FRAT1Q92837 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
FRAT1Q92837 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
FRAT1Q92837 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
FRAT1Q92837 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
FRAT1Q92837 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
FRAT1Q92837 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
FRAT1Q92837 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
FRAT1Q92837 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
FRAT1Q92837 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
FRAT1Q92837 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
FRAT1Q92837 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
FRAT1Q92837 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
FRAT1Q92837 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FRAT1Q92837 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.47■■■□□ 2.79
FRAT1Q92837 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FRAT1Q92837 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FRAT1Q92837 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
FRAT1Q92837 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
FRAT1Q92837 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
FRAT1Q92837 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
FRAT1Q92837 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
FRAT1Q92837 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
FRAT1Q92837 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
FRAT1Q92837 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
FRAT1Q92837 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
FRAT1Q92837 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
FRAT1Q92837 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
FRAT1Q92837 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
FRAT1Q92837 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
FRAT1Q92837 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
FRAT1Q92837 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
FRAT1Q92837 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
FRAT1Q92837 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
FRAT1Q92837 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
FRAT1Q92837 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
FRAT1Q92837 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
FRAT1Q92837 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
FRAT1Q92837 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
FRAT1Q92837 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
FRAT1Q92837 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
FRAT1Q92837 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
FRAT1Q92837 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
FRAT1Q92837 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
FRAT1Q92837 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
FRAT1Q92837 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
FRAT1Q92837 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC32.34■■■□□ 2.77
FRAT1Q92837 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
FRAT1Q92837 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.9 ms