Protein–RNA interactions for Protein: Q92664

GTF3A, Transcription factor IIIA, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3AQ92664 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
GTF3AQ92664 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3AQ92664 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3AQ92664 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3AQ92664 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3AQ92664 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
GTF3AQ92664 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3AQ92664 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3AQ92664 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3AQ92664 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
GTF3AQ92664 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3AQ92664 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3AQ92664 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3AQ92664 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3AQ92664 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GTF3AQ92664 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3AQ92664 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3AQ92664 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3AQ92664 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3AQ92664 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GTF3AQ92664 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3AQ92664 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3AQ92664 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
GTF3AQ92664 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF3AQ92664 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF3AQ92664 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF3AQ92664 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GTF3AQ92664 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GTF3AQ92664 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF3AQ92664 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF3AQ92664 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF3AQ92664 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF3AQ92664 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF3AQ92664 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GTF3AQ92664 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3AQ92664 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3AQ92664 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3AQ92664 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3AQ92664 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3AQ92664 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3AQ92664 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GTF3AQ92664 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF3AQ92664 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
GTF3AQ92664 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3AQ92664 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3AQ92664 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3AQ92664 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3AQ92664 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
GTF3AQ92664 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3AQ92664 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3AQ92664 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3AQ92664 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
GTF3AQ92664 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3AQ92664 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3AQ92664 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
GTF3AQ92664 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3AQ92664 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
GTF3AQ92664 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3AQ92664 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3AQ92664 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3AQ92664 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
GTF3AQ92664 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3AQ92664 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
GTF3AQ92664 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF3AQ92664 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF3AQ92664 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF3AQ92664 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
GTF3AQ92664 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF3AQ92664 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
GTF3AQ92664 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms