Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD9

CASKIN1, Caskin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKIN1Q8WXD9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
CASKIN1Q8WXD9 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.3■■■■■ 4.04
CASKIN1Q8WXD9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
CASKIN1Q8WXD9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
CASKIN1Q8WXD9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
CASKIN1Q8WXD9 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
CASKIN1Q8WXD9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC40.27■■■■■ 4.04
CASKIN1Q8WXD9 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
CASKIN1Q8WXD9 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.26■■■■■ 4.04
CASKIN1Q8WXD9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC40.26■■■■■ 4.04
CASKIN1Q8WXD9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC40.26■■■■■ 4.03
CASKIN1Q8WXD9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CASKIN1Q8WXD9 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
CASKIN1Q8WXD9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC40.25■■■■■ 4.03
CASKIN1Q8WXD9 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
CASKIN1Q8WXD9 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC40.25■■■■■ 4.03
CASKIN1Q8WXD9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC40.25■■■■■ 4.03
CASKIN1Q8WXD9 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.24■■■■■ 4.03
CASKIN1Q8WXD9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
CASKIN1Q8WXD9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
CASKIN1Q8WXD9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
CASKIN1Q8WXD9 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
CASKIN1Q8WXD9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CASKIN1Q8WXD9 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
CASKIN1Q8WXD9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
CASKIN1Q8WXD9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC40.2■■■■■ 4.03
CASKIN1Q8WXD9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
CASKIN1Q8WXD9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
CASKIN1Q8WXD9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC40.19■■■■■ 4.02
CASKIN1Q8WXD9 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
CASKIN1Q8WXD9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
CASKIN1Q8WXD9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CASKIN1Q8WXD9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CASKIN1Q8WXD9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
CASKIN1Q8WXD9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
CASKIN1Q8WXD9 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
CASKIN1Q8WXD9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC40.13■■■■■ 4.01
CASKIN1Q8WXD9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
CASKIN1Q8WXD9 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
CASKIN1Q8WXD9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC40.12■■■■■ 4.01
CASKIN1Q8WXD9 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC40.12■■■■■ 4.01
CASKIN1Q8WXD9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
CASKIN1Q8WXD9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
CASKIN1Q8WXD9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
CASKIN1Q8WXD9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
CASKIN1Q8WXD9 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC40.09■■■■■ 4.01
CASKIN1Q8WXD9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
CASKIN1Q8WXD9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
CASKIN1Q8WXD9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4.01
CASKIN1Q8WXD9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
CASKIN1Q8WXD9 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.07■■■■■ 4
CASKIN1Q8WXD9 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
CASKIN1Q8WXD9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
CASKIN1Q8WXD9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC40.07■■■■■ 4
CASKIN1Q8WXD9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC40.07■■■■■ 4
CASKIN1Q8WXD9 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.06■■■■■ 4
CASKIN1Q8WXD9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
CASKIN1Q8WXD9 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
CASKIN1Q8WXD9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC40.04■■■■■ 4
CASKIN1Q8WXD9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
CASKIN1Q8WXD9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CASKIN1Q8WXD9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.03■■■■■ 4
CASKIN1Q8WXD9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC40.03■■■■■ 4
CASKIN1Q8WXD9 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
CASKIN1Q8WXD9 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
CASKIN1Q8WXD9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
CASKIN1Q8WXD9 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
CASKIN1Q8WXD9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
CASKIN1Q8WXD9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC40.01■■■■□ 3.99
CASKIN1Q8WXD9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC40.01■■■■□ 3.99
CASKIN1Q8WXD9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC40■■■■□ 3.99
CASKIN1Q8WXD9 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC40■■■■□ 3.99
CASKIN1Q8WXD9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC39.99■■■■□ 3.99
CASKIN1Q8WXD9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC39.99■■■■□ 3.99
CASKIN1Q8WXD9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
CASKIN1Q8WXD9 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC39.99■■■■□ 3.99
CASKIN1Q8WXD9 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC39.98■■■■□ 3.99
CASKIN1Q8WXD9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.98■■■■□ 3.99
CASKIN1Q8WXD9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CASKIN1Q8WXD9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CASKIN1Q8WXD9 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.97■■■■□ 3.99
CASKIN1Q8WXD9 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.96■■■■□ 3.99
CASKIN1Q8WXD9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
CASKIN1Q8WXD9 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC39.95■■■■□ 3.99
CASKIN1Q8WXD9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC39.95■■■■□ 3.99
CASKIN1Q8WXD9 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.94■■■■□ 3.98
CASKIN1Q8WXD9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC39.94■■■■□ 3.98
CASKIN1Q8WXD9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.93■■■■□ 3.98
CASKIN1Q8WXD9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC39.93■■■■□ 3.98
CASKIN1Q8WXD9 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC39.91■■■■□ 3.98
CASKIN1Q8WXD9 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
CASKIN1Q8WXD9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CASKIN1Q8WXD9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC39.9■■■■□ 3.98
CASKIN1Q8WXD9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
CASKIN1Q8WXD9 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC39.89■■■■□ 3.98
CASKIN1Q8WXD9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
CASKIN1Q8WXD9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.88■■■■□ 3.97
CASKIN1Q8WXD9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.88■■■■□ 3.97
CASKIN1Q8WXD9 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.87■■■■□ 3.97
CASKIN1Q8WXD9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 835.1 ms