Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFF2

SLC24A4, Sodium/potassium/calcium exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A4Q8NFF2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SLC24A4Q8NFF2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC24A4Q8NFF2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC24A4Q8NFF2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC24A4Q8NFF2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC24A4Q8NFF2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC24A4Q8NFF2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SLC24A4Q8NFF2 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC24A4Q8NFF2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC24A4Q8NFF2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC24A4Q8NFF2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SLC24A4Q8NFF2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC24A4Q8NFF2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC24A4Q8NFF2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC24A4Q8NFF2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC24A4Q8NFF2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC24A4Q8NFF2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC24A4Q8NFF2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC24A4Q8NFF2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC24A4Q8NFF2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC24A4Q8NFF2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SLC24A4Q8NFF2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC24A4Q8NFF2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC24A4Q8NFF2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC24A4Q8NFF2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SLC24A4Q8NFF2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC24A4Q8NFF2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC24A4Q8NFF2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC24A4Q8NFF2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC24A4Q8NFF2 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SLC24A4Q8NFF2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC24A4Q8NFF2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC24A4Q8NFF2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC24A4Q8NFF2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC24A4Q8NFF2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC24A4Q8NFF2 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC24A4Q8NFF2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC24A4Q8NFF2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC24A4Q8NFF2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC24A4Q8NFF2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC24A4Q8NFF2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC24A4Q8NFF2 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC24A4Q8NFF2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC24A4Q8NFF2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A4Q8NFF2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A4Q8NFF2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A4Q8NFF2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A4Q8NFF2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A4Q8NFF2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC24A4Q8NFF2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A4Q8NFF2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A4Q8NFF2 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A4Q8NFF2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A4Q8NFF2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC24A4Q8NFF2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A4Q8NFF2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A4Q8NFF2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A4Q8NFF2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC24A4Q8NFF2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A4Q8NFF2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC24A4Q8NFF2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC24A4Q8NFF2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
SLC24A4Q8NFF2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC24A4Q8NFF2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC24A4Q8NFF2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SLC24A4Q8NFF2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
SLC24A4Q8NFF2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms