Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6L1

KRTCAP2, Keratinocyte-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTCAP2Q8N6L1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
KRTCAP2Q8N6L1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRTCAP2Q8N6L1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRTCAP2Q8N6L1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRTCAP2Q8N6L1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRTCAP2Q8N6L1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
KRTCAP2Q8N6L1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
KRTCAP2Q8N6L1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
KRTCAP2Q8N6L1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
KRTCAP2Q8N6L1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRTCAP2Q8N6L1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRTCAP2Q8N6L1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRTCAP2Q8N6L1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRTCAP2Q8N6L1 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
KRTCAP2Q8N6L1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRTCAP2Q8N6L1 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRTCAP2Q8N6L1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
KRTCAP2Q8N6L1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRTCAP2Q8N6L1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
KRTCAP2Q8N6L1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRTCAP2Q8N6L1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
KRTCAP2Q8N6L1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRTCAP2Q8N6L1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRTCAP2Q8N6L1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRTCAP2Q8N6L1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRTCAP2Q8N6L1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRTCAP2Q8N6L1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
KRTCAP2Q8N6L1 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRTCAP2Q8N6L1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRTCAP2Q8N6L1 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRTCAP2Q8N6L1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
KRTCAP2Q8N6L1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRTCAP2Q8N6L1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRTCAP2Q8N6L1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRTCAP2Q8N6L1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRTCAP2Q8N6L1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRTCAP2Q8N6L1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRTCAP2Q8N6L1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRTCAP2Q8N6L1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
KRTCAP2Q8N6L1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
KRTCAP2Q8N6L1 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRTCAP2Q8N6L1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
KRTCAP2Q8N6L1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
KRTCAP2Q8N6L1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRTCAP2Q8N6L1 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRTCAP2Q8N6L1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRTCAP2Q8N6L1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KRTCAP2Q8N6L1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRTCAP2Q8N6L1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KRTCAP2Q8N6L1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRTCAP2Q8N6L1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KRTCAP2Q8N6L1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRTCAP2Q8N6L1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRTCAP2Q8N6L1 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRTCAP2Q8N6L1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRTCAP2Q8N6L1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRTCAP2Q8N6L1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRTCAP2Q8N6L1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRTCAP2Q8N6L1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRTCAP2Q8N6L1 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRTCAP2Q8N6L1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRTCAP2Q8N6L1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRTCAP2Q8N6L1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRTCAP2Q8N6L1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRTCAP2Q8N6L1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRTCAP2Q8N6L1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRTCAP2Q8N6L1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRTCAP2Q8N6L1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRTCAP2Q8N6L1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRTCAP2Q8N6L1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRTCAP2Q8N6L1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRTCAP2Q8N6L1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRTCAP2Q8N6L1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRTCAP2Q8N6L1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KRTCAP2Q8N6L1 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRTCAP2Q8N6L1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRTCAP2Q8N6L1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRTCAP2Q8N6L1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRTCAP2Q8N6L1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRTCAP2Q8N6L1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRTCAP2Q8N6L1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
KRTCAP2Q8N6L1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRTCAP2Q8N6L1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRTCAP2Q8N6L1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRTCAP2Q8N6L1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRTCAP2Q8N6L1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRTCAP2Q8N6L1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRTCAP2Q8N6L1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRTCAP2Q8N6L1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRTCAP2Q8N6L1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRTCAP2Q8N6L1 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRTCAP2Q8N6L1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRTCAP2Q8N6L1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRTCAP2Q8N6L1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRTCAP2Q8N6L1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRTCAP2Q8N6L1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
KRTCAP2Q8N6L1 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRTCAP2Q8N6L1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRTCAP2Q8N6L1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRTCAP2Q8N6L1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms