Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1B4

VPS52, Vacuolar protein sorting-associated protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS52Q8N1B4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS52Q8N1B4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS52Q8N1B4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS52Q8N1B4 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
VPS52Q8N1B4 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VPS52Q8N1B4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
VPS52Q8N1B4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
VPS52Q8N1B4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
VPS52Q8N1B4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS52Q8N1B4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS52Q8N1B4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS52Q8N1B4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS52Q8N1B4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS52Q8N1B4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS52Q8N1B4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
VPS52Q8N1B4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
VPS52Q8N1B4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
VPS52Q8N1B4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VPS52Q8N1B4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VPS52Q8N1B4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
VPS52Q8N1B4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
VPS52Q8N1B4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS52Q8N1B4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS52Q8N1B4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
VPS52Q8N1B4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VPS52Q8N1B4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
VPS52Q8N1B4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
VPS52Q8N1B4 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
VPS52Q8N1B4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VPS52Q8N1B4 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VPS52Q8N1B4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
VPS52Q8N1B4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
VPS52Q8N1B4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VPS52Q8N1B4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VPS52Q8N1B4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VPS52Q8N1B4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
VPS52Q8N1B4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS52Q8N1B4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS52Q8N1B4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS52Q8N1B4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS52Q8N1B4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS52Q8N1B4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS52Q8N1B4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
VPS52Q8N1B4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS52Q8N1B4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS52Q8N1B4 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS52Q8N1B4 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS52Q8N1B4 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS52Q8N1B4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS52Q8N1B4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS52Q8N1B4 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS52Q8N1B4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS52Q8N1B4 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
VPS52Q8N1B4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
VPS52Q8N1B4 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
VPS52Q8N1B4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
VPS52Q8N1B4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
VPS52Q8N1B4 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS52Q8N1B4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS52Q8N1B4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
VPS52Q8N1B4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS52Q8N1B4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
VPS52Q8N1B4 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms