Protein–RNA interactions for Protein: Q8N118

CYP4X1, Cytochrome P450 4X1, humanhuman

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4X1Q8N118 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CYP4X1Q8N118 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP4X1Q8N118 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP4X1Q8N118 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP4X1Q8N118 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP4X1Q8N118 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CYP4X1Q8N118 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYP4X1Q8N118 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYP4X1Q8N118 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYP4X1Q8N118 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CYP4X1Q8N118 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CYP4X1Q8N118 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP4X1Q8N118 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP4X1Q8N118 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CYP4X1Q8N118 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP4X1Q8N118 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CYP4X1Q8N118 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP4X1Q8N118 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP4X1Q8N118 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP4X1Q8N118 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CYP4X1Q8N118 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP4X1Q8N118 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP4X1Q8N118 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CYP4X1Q8N118 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP4X1Q8N118 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CYP4X1Q8N118 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP4X1Q8N118 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP4X1Q8N118 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CYP4X1Q8N118 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYP4X1Q8N118 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYP4X1Q8N118 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CYP4X1Q8N118 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CYP4X1Q8N118 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CYP4X1Q8N118 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYP4X1Q8N118 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CYP4X1Q8N118 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP4X1Q8N118 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP4X1Q8N118 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP4X1Q8N118 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP4X1Q8N118 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CYP4X1Q8N118 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP4X1Q8N118 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP4X1Q8N118 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP4X1Q8N118 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CYP4X1Q8N118 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP4X1Q8N118 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP4X1Q8N118 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP4X1Q8N118 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP4X1Q8N118 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP4X1Q8N118 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CYP4X1Q8N118 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CYP4X1Q8N118 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP4X1Q8N118 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CYP4X1Q8N118 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYP4X1Q8N118 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYP4X1Q8N118 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYP4X1Q8N118 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CYP4X1Q8N118 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYP4X1Q8N118 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CYP4X1Q8N118 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYP4X1Q8N118 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYP4X1Q8N118 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYP4X1Q8N118 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYP4X1Q8N118 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CYP4X1Q8N118 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP4X1Q8N118 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP4X1Q8N118 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CYP4X1Q8N118 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP4X1Q8N118 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CYP4X1Q8N118 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP4X1Q8N118 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP4X1Q8N118 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP4X1Q8N118 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CYP4X1Q8N118 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP4X1Q8N118 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP4X1Q8N118 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CYP4X1Q8N118 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP4X1Q8N118 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP4X1Q8N118 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP4X1Q8N118 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP4X1Q8N118 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP4X1Q8N118 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP4X1Q8N118 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CYP4X1Q8N118 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP4X1Q8N118 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP4X1Q8N118 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP4X1Q8N118 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP4X1Q8N118 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP4X1Q8N118 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP4X1Q8N118 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CYP4X1Q8N118 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP4X1Q8N118 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP4X1Q8N118 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP4X1Q8N118 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CYP4X1Q8N118 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP4X1Q8N118 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP4X1Q8N118 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP4X1Q8N118 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CYP4X1Q8N118 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CYP4X1Q8N118 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms