Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZT8

HS3ST5, Heparan sulfate glucosamine 3-O-sulfotransferase 5, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HS3ST5Q8IZT8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HS3ST5Q8IZT8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HS3ST5Q8IZT8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HS3ST5Q8IZT8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HS3ST5Q8IZT8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HS3ST5Q8IZT8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HS3ST5Q8IZT8 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HS3ST5Q8IZT8 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HS3ST5Q8IZT8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HS3ST5Q8IZT8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HS3ST5Q8IZT8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HS3ST5Q8IZT8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HS3ST5Q8IZT8 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HS3ST5Q8IZT8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HS3ST5Q8IZT8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS3ST5Q8IZT8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HS3ST5Q8IZT8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HS3ST5Q8IZT8 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HS3ST5Q8IZT8 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HS3ST5Q8IZT8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HS3ST5Q8IZT8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HS3ST5Q8IZT8 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HS3ST5Q8IZT8 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HS3ST5Q8IZT8 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HS3ST5Q8IZT8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HS3ST5Q8IZT8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS3ST5Q8IZT8 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS3ST5Q8IZT8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS3ST5Q8IZT8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HS3ST5Q8IZT8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS3ST5Q8IZT8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS3ST5Q8IZT8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HS3ST5Q8IZT8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS3ST5Q8IZT8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS3ST5Q8IZT8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS3ST5Q8IZT8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HS3ST5Q8IZT8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS3ST5Q8IZT8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
HS3ST5Q8IZT8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS3ST5Q8IZT8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS3ST5Q8IZT8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS3ST5Q8IZT8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS3ST5Q8IZT8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS3ST5Q8IZT8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
HS3ST5Q8IZT8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
HS3ST5Q8IZT8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HS3ST5Q8IZT8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HS3ST5Q8IZT8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HS3ST5Q8IZT8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
HS3ST5Q8IZT8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
HS3ST5Q8IZT8 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS3ST5Q8IZT8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS3ST5Q8IZT8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
HS3ST5Q8IZT8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS3ST5Q8IZT8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
HS3ST5Q8IZT8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS3ST5Q8IZT8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS3ST5Q8IZT8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
HS3ST5Q8IZT8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS3ST5Q8IZT8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS3ST5Q8IZT8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS3ST5Q8IZT8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS3ST5Q8IZT8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS3ST5Q8IZT8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS3ST5Q8IZT8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
HS3ST5Q8IZT8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HS3ST5Q8IZT8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HS3ST5Q8IZT8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HS3ST5Q8IZT8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
HS3ST5Q8IZT8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
HS3ST5Q8IZT8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
HS3ST5Q8IZT8 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HS3ST5Q8IZT8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HS3ST5Q8IZT8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
HS3ST5Q8IZT8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
HS3ST5Q8IZT8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HS3ST5Q8IZT8 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
HS3ST5Q8IZT8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HS3ST5Q8IZT8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HS3ST5Q8IZT8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HS3ST5Q8IZT8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HS3ST5Q8IZT8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HS3ST5Q8IZT8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
HS3ST5Q8IZT8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
HS3ST5Q8IZT8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HS3ST5Q8IZT8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HS3ST5Q8IZT8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HS3ST5Q8IZT8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HS3ST5Q8IZT8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HS3ST5Q8IZT8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HS3ST5Q8IZT8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HS3ST5Q8IZT8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HS3ST5Q8IZT8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HS3ST5Q8IZT8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HS3ST5Q8IZT8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HS3ST5Q8IZT8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HS3ST5Q8IZT8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HS3ST5Q8IZT8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HS3ST5Q8IZT8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HS3ST5Q8IZT8 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms