Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZS8

CACNA2D3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D3Q8IZS8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CACNA2D3Q8IZS8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA2D3Q8IZS8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA2D3Q8IZS8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA2D3Q8IZS8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA2D3Q8IZS8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA2D3Q8IZS8 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CACNA2D3Q8IZS8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA2D3Q8IZS8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA2D3Q8IZS8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA2D3Q8IZS8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CACNA2D3Q8IZS8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA2D3Q8IZS8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA2D3Q8IZS8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CACNA2D3Q8IZS8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNA2D3Q8IZS8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNA2D3Q8IZS8 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNA2D3Q8IZS8 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNA2D3Q8IZS8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNA2D3Q8IZS8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNA2D3Q8IZS8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CACNA2D3Q8IZS8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA2D3Q8IZS8 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA2D3Q8IZS8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA2D3Q8IZS8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA2D3Q8IZS8 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA2D3Q8IZS8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA2D3Q8IZS8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA2D3Q8IZS8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA2D3Q8IZS8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CACNA2D3Q8IZS8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA2D3Q8IZS8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA2D3Q8IZS8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CACNA2D3Q8IZS8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA2D3Q8IZS8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA2D3Q8IZS8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA2D3Q8IZS8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA2D3Q8IZS8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA2D3Q8IZS8 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CACNA2D3Q8IZS8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA2D3Q8IZS8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA2D3Q8IZS8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CACNA2D3Q8IZS8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA2D3Q8IZS8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA2D3Q8IZS8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA2D3Q8IZS8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CACNA2D3Q8IZS8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNA2D3Q8IZS8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNA2D3Q8IZS8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNA2D3Q8IZS8 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNA2D3Q8IZS8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CACNA2D3Q8IZS8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA2D3Q8IZS8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA2D3Q8IZS8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA2D3Q8IZS8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNA2D3Q8IZS8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CACNA2D3Q8IZS8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNA2D3Q8IZS8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNA2D3Q8IZS8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA2D3Q8IZS8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA2D3Q8IZS8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA2D3Q8IZS8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA2D3Q8IZS8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA2D3Q8IZS8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA2D3Q8IZS8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNA2D3Q8IZS8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA2D3Q8IZS8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA2D3Q8IZS8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA2D3Q8IZS8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNA2D3Q8IZS8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA2D3Q8IZS8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA2D3Q8IZS8 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA2D3Q8IZS8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA2D3Q8IZS8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA2D3Q8IZS8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNA2D3Q8IZS8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA2D3Q8IZS8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA2D3Q8IZS8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNA2D3Q8IZS8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA2D3Q8IZS8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA2D3Q8IZS8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNA2D3Q8IZS8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA2D3Q8IZS8 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA2D3Q8IZS8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA2D3Q8IZS8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA2D3Q8IZS8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA2D3Q8IZS8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNA2D3Q8IZS8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA2D3Q8IZS8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA2D3Q8IZS8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA2D3Q8IZS8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNA2D3Q8IZS8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA2D3Q8IZS8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA2D3Q8IZS8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA2D3Q8IZS8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA2D3Q8IZS8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA2D3Q8IZS8 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA2D3Q8IZS8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CACNA2D3Q8IZS8 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms