Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXN7

RIMKLA, N-acetylaspartylglutamate synthase A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIMKLAQ8IXN7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RIMKLAQ8IXN7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RIMKLAQ8IXN7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RIMKLAQ8IXN7 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMKLAQ8IXN7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMKLAQ8IXN7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMKLAQ8IXN7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMKLAQ8IXN7 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMKLAQ8IXN7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMKLAQ8IXN7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RIMKLAQ8IXN7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMKLAQ8IXN7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMKLAQ8IXN7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMKLAQ8IXN7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RIMKLAQ8IXN7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIMKLAQ8IXN7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RIMKLAQ8IXN7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RIMKLAQ8IXN7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIMKLAQ8IXN7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIMKLAQ8IXN7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RIMKLAQ8IXN7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIMKLAQ8IXN7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIMKLAQ8IXN7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIMKLAQ8IXN7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIMKLAQ8IXN7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RIMKLAQ8IXN7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIMKLAQ8IXN7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIMKLAQ8IXN7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RIMKLAQ8IXN7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIMKLAQ8IXN7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIMKLAQ8IXN7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIMKLAQ8IXN7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIMKLAQ8IXN7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RIMKLAQ8IXN7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
RIMKLAQ8IXN7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
RIMKLAQ8IXN7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIMKLAQ8IXN7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIMKLAQ8IXN7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RIMKLAQ8IXN7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RIMKLAQ8IXN7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
RIMKLAQ8IXN7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RIMKLAQ8IXN7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIMKLAQ8IXN7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIMKLAQ8IXN7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIMKLAQ8IXN7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIMKLAQ8IXN7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RIMKLAQ8IXN7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIMKLAQ8IXN7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIMKLAQ8IXN7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIMKLAQ8IXN7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RIMKLAQ8IXN7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIMKLAQ8IXN7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIMKLAQ8IXN7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIMKLAQ8IXN7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIMKLAQ8IXN7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIMKLAQ8IXN7 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RIMKLAQ8IXN7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIMKLAQ8IXN7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIMKLAQ8IXN7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIMKLAQ8IXN7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIMKLAQ8IXN7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIMKLAQ8IXN7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RIMKLAQ8IXN7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RIMKLAQ8IXN7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIMKLAQ8IXN7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIMKLAQ8IXN7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RIMKLAQ8IXN7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIMKLAQ8IXN7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RIMKLAQ8IXN7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
RIMKLAQ8IXN7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIMKLAQ8IXN7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RIMKLAQ8IXN7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMKLAQ8IXN7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RIMKLAQ8IXN7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIMKLAQ8IXN7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIMKLAQ8IXN7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIMKLAQ8IXN7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIMKLAQ8IXN7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RIMKLAQ8IXN7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIMKLAQ8IXN7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIMKLAQ8IXN7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIMKLAQ8IXN7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RIMKLAQ8IXN7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIMKLAQ8IXN7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIMKLAQ8IXN7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RIMKLAQ8IXN7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIMKLAQ8IXN7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RIMKLAQ8IXN7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
RIMKLAQ8IXN7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIMKLAQ8IXN7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RIMKLAQ8IXN7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIMKLAQ8IXN7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
RIMKLAQ8IXN7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIMKLAQ8IXN7 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIMKLAQ8IXN7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24■■□□□ 1.43
RIMKLAQ8IXN7 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIMKLAQ8IXN7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIMKLAQ8IXN7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RIMKLAQ8IXN7 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RIMKLAQ8IXN7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms