Protein–RNA interactions for Protein: Q86YV5

PRAG1, Tyrosine-protein kinase PRAG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAG1Q86YV5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PRAG1Q86YV5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PRAG1Q86YV5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PRAG1Q86YV5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PRAG1Q86YV5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PRAG1Q86YV5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PRAG1Q86YV5 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PRAG1Q86YV5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
PRAG1Q86YV5 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC36.67■■■■□ 3.46
PRAG1Q86YV5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PRAG1Q86YV5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PRAG1Q86YV5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
PRAG1Q86YV5 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PRAG1Q86YV5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC36.64■■■■□ 3.46
PRAG1Q86YV5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PRAG1Q86YV5 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PRAG1Q86YV5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PRAG1Q86YV5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PRAG1Q86YV5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PRAG1Q86YV5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
PRAG1Q86YV5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PRAG1Q86YV5 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PRAG1Q86YV5 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
PRAG1Q86YV5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PRAG1Q86YV5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PRAG1Q86YV5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PRAG1Q86YV5 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PRAG1Q86YV5 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PRAG1Q86YV5 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PRAG1Q86YV5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PRAG1Q86YV5 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PRAG1Q86YV5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PRAG1Q86YV5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PRAG1Q86YV5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
PRAG1Q86YV5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PRAG1Q86YV5 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PRAG1Q86YV5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
PRAG1Q86YV5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PRAG1Q86YV5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
PRAG1Q86YV5 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PRAG1Q86YV5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
PRAG1Q86YV5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
PRAG1Q86YV5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
PRAG1Q86YV5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
PRAG1Q86YV5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PRAG1Q86YV5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PRAG1Q86YV5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PRAG1Q86YV5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PRAG1Q86YV5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PRAG1Q86YV5 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PRAG1Q86YV5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
PRAG1Q86YV5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PRAG1Q86YV5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PRAG1Q86YV5 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PRAG1Q86YV5 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PRAG1Q86YV5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
PRAG1Q86YV5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PRAG1Q86YV5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
PRAG1Q86YV5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
PRAG1Q86YV5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
PRAG1Q86YV5 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
PRAG1Q86YV5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PRAG1Q86YV5 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PRAG1Q86YV5 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PRAG1Q86YV5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
PRAG1Q86YV5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PRAG1Q86YV5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PRAG1Q86YV5 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
PRAG1Q86YV5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
PRAG1Q86YV5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PRAG1Q86YV5 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PRAG1Q86YV5 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC36.47■■■■□ 3.43
PRAG1Q86YV5 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PRAG1Q86YV5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PRAG1Q86YV5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
PRAG1Q86YV5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
PRAG1Q86YV5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.46■■■■□ 3.43
PRAG1Q86YV5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC36.46■■■■□ 3.43
PRAG1Q86YV5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PRAG1Q86YV5 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PRAG1Q86YV5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC36.45■■■■□ 3.43
PRAG1Q86YV5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
PRAG1Q86YV5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PRAG1Q86YV5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PRAG1Q86YV5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PRAG1Q86YV5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PRAG1Q86YV5 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
PRAG1Q86YV5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PRAG1Q86YV5 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PRAG1Q86YV5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PRAG1Q86YV5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PRAG1Q86YV5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PRAG1Q86YV5 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PRAG1Q86YV5 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PRAG1Q86YV5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC36.4■■■■□ 3.42
PRAG1Q86YV5 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
PRAG1Q86YV5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PRAG1Q86YV5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PRAG1Q86YV5 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
PRAG1Q86YV5 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms