Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LCA5Q86VQ0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCA5Q86VQ0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCA5Q86VQ0 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCA5Q86VQ0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LCA5Q86VQ0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCA5Q86VQ0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LCA5Q86VQ0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LCA5Q86VQ0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LCA5Q86VQ0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LCA5Q86VQ0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LCA5Q86VQ0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LCA5Q86VQ0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LCA5Q86VQ0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCA5Q86VQ0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCA5Q86VQ0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCA5Q86VQ0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCA5Q86VQ0 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LCA5Q86VQ0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCA5Q86VQ0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCA5Q86VQ0 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LCA5Q86VQ0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LCA5Q86VQ0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LCA5Q86VQ0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LCA5Q86VQ0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LCA5Q86VQ0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCA5Q86VQ0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCA5Q86VQ0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCA5Q86VQ0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCA5Q86VQ0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCA5Q86VQ0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LCA5Q86VQ0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LCA5Q86VQ0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCA5Q86VQ0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCA5Q86VQ0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LCA5Q86VQ0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LCA5Q86VQ0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCA5Q86VQ0 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCA5Q86VQ0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LCA5Q86VQ0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LCA5Q86VQ0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LCA5Q86VQ0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LCA5Q86VQ0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCA5Q86VQ0 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCA5Q86VQ0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LCA5Q86VQ0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCA5Q86VQ0 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCA5Q86VQ0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCA5Q86VQ0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCA5Q86VQ0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LCA5Q86VQ0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LCA5Q86VQ0 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LCA5Q86VQ0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LCA5Q86VQ0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
LCA5Q86VQ0 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LCA5Q86VQ0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LCA5Q86VQ0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LCA5Q86VQ0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LCA5Q86VQ0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LCA5Q86VQ0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LCA5Q86VQ0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LCA5Q86VQ0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LCA5Q86VQ0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LCA5Q86VQ0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LCA5Q86VQ0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LCA5Q86VQ0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LCA5Q86VQ0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LCA5Q86VQ0 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LCA5Q86VQ0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LCA5Q86VQ0 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LCA5Q86VQ0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LCA5Q86VQ0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LCA5Q86VQ0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LCA5Q86VQ0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LCA5Q86VQ0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LCA5Q86VQ0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LCA5Q86VQ0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LCA5Q86VQ0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LCA5Q86VQ0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LCA5Q86VQ0 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LCA5Q86VQ0 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LCA5Q86VQ0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LCA5Q86VQ0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LCA5Q86VQ0 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LCA5Q86VQ0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LCA5Q86VQ0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LCA5Q86VQ0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
LCA5Q86VQ0 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LCA5Q86VQ0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LCA5Q86VQ0 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LCA5Q86VQ0 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LCA5Q86VQ0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LCA5Q86VQ0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LCA5Q86VQ0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LCA5Q86VQ0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LCA5Q86VQ0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LCA5Q86VQ0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LCA5Q86VQ0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LCA5Q86VQ0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LCA5Q86VQ0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms