Protein–RNA interactions for Protein: Q7KZF4

SND1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SND1Q7KZF4 GANAB-202ENST00000356638 3608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.751e-20■■■■■ 32.6
SND1Q7KZF4 CPVL-207ENST00000448959 874 ntTSL 212.3□□□□□ -0.445e-7■■■■■ 32.6
SND1Q7KZF4 CADM1-220ENST00000546000 734 ntTSL 1 (best)17.66■□□□□ 0.427e-11■■■■■ 32.6
SND1Q7KZF4 CADM1-219ENST00000545960 630 ntTSL 516.28■□□□□ 0.27e-11■■■■■ 32.6
SND1Q7KZF4 CADM1-209ENST00000540852 476 ntTSL 215.66■□□□□ 0.17e-11■■■■■ 32.6
SND1Q7KZF4 CADM1-215ENST00000543375 668 ntTSL 312.76□□□□□ -0.377e-11■■■■■ 32.6
SND1Q7KZF4 HYOU1-222ENST00000622474 549 ntTSL 216.7■□□□□ 0.267e-14■■■■■ 32.6
SND1Q7KZF4 TFRC-215ENST00000491658 396 ntTSL 56.92□□□□□ -1.31e-12■■■■■ 32.5
SND1Q7KZF4 SYPL1-201ENST00000011473 2127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.414e-12■■■■■ 32.5
SND1Q7KZF4 SYPL1-202ENST00000455385 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.624e-12■■■■■ 32.5
SND1Q7KZF4 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.154e-12■■■■■ 32.5
SND1Q7KZF4 SYPL1-207ENST00000634737 835 ntTSL 57□□□□□ -1.294e-12■■■■■ 32.5
SND1Q7KZF4 MPZ-205ENST00000526189 957 ntTSL 319.66■□□□□ 0.746e-8■■■■■ 32.5
SND1Q7KZF4 ATP6V0A1-207ENST00000585828 2139 ntTSL 1 (best)16.73■□□□□ 0.277e-7■■■■■ 32.5
SND1Q7KZF4 ATP6V0A1-209ENST00000586201 881 ntTSL 313.04□□□□□ -0.327e-7■■■■■ 32.5
SND1Q7KZF4 ATP6V0A1-217ENST00000588138 573 ntTSL 512.35□□□□□ -0.437e-7■■■■■ 32.5
SND1Q7KZF4 ATP6V0A1-219ENST00000588806 842 ntTSL 212.33□□□□□ -0.441e-6■■■■■ 32.5
SND1Q7KZF4 ITGA1-203ENST00000504669 6276 ntTSL 1 (best)11.61□□□□□ -0.553e-7■■■■■ 32.5
SND1Q7KZF4 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.89□□□□□ -1.153e-7■■■■■ 32.5
SND1Q7KZF4 ITGA1-204ENST00000506275 7461 ntTSL 1 (best)2.82□□□□□ -1.963e-7■■■■■ 32.5
SND1Q7KZF4 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.135e-8■■■■■ 32.4
SND1Q7KZF4 C22orf34-205ENST00000416411 542 ntTSL 414.37□□□□□ -0.115e-8■■■■■ 32.4
SND1Q7KZF4 CPVL-210ENST00000455893 561 ntTSL 54.71□□□□□ -1.669e-10■■■■■ 32.4
SND1Q7KZF4 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.13e-9■■■■■ 32.4
SND1Q7KZF4 GANAB-213ENST00000534422 702 ntTSL 512□□□□□ -0.495e-27■■■■■ 32.4
SND1Q7KZF4 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.722e-14■■■■■ 32.4
SND1Q7KZF4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.512e-14■■■■■ 32.4
SND1Q7KZF4 PDIA6-204ENST00000404824 2236 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.262e-14■■■■■ 32.4
SND1Q7KZF4 PDIA6-208ENST00000617249 2344 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.292e-14■■■■■ 32.4
SND1Q7KZF4 PDIA6-202ENST00000381611 2534 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.592e-14■■■■■ 32.4
SND1Q7KZF4 PDIA6-203ENST00000404371 2682 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.652e-14■■■■■ 32.4
SND1Q7KZF4 DGKI-206ENST00000470895 922 ntTSL 321.23■□□□□ 0.998e-9■■■■■ 32.3
SND1Q7KZF4 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.938e-9■■■■■ 32.3
SND1Q7KZF4 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.778e-9■■■■■ 32.3
SND1Q7KZF4 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.368e-9■■■■■ 32.3
SND1Q7KZF4 CCT6A-205ENST00000466572 686 ntTSL 212.74□□□□□ -0.378e-9■■■■■ 32.3
SND1Q7KZF4 CCT6A-203ENST00000462133 665 ntTSL 311.32□□□□□ -0.68e-9■■■■■ 32.3
SND1Q7KZF4 DGKI-209ENST00000483619 551 ntTSL 46.69□□□□□ -1.348e-9■■■■■ 32.3
SND1Q7KZF4 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.648e-9■■■■■ 32.3
SND1Q7KZF4 EPCAM-205ENST00000474691 714 ntTSL 514.33□□□□□ -0.121e-12■■■■■ 32.2
SND1Q7KZF4 GANAB-204ENST00000525994 390 ntTSL 416.11■□□□□ 0.176e-28■■■■■ 32.2
SND1Q7KZF4 P4HB-215ENST00000571507 493 ntTSL 25.65□□□□□ -1.55e-22■■■■■ 32.1
SND1Q7KZF4 GPR107-206ENST00000483935 177 ntTSL 52.28□□□□□ -2.042e-6■■■■■ 32.1
SND1Q7KZF4 STT3A-207ENST00000526364 617 ntTSL 36.06□□□□□ -1.447e-10■■■■■ 32.1
SND1Q7KZF4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.992e-20■■■■■ 32
SND1Q7KZF4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.932e-20■■■■■ 32
SND1Q7KZF4 BZW1-208ENST00000452206 1059 ntTSL 513.84□□□□□ -0.192e-20■■■■■ 32
SND1Q7KZF4 BZW1-206ENST00000447069 557 ntTSL 410.86□□□□□ -0.672e-20■■■■■ 32
SND1Q7KZF4 BZW1-204ENST00000410110 1075 ntTSL 510.74□□□□□ -0.692e-20■■■■■ 32
SND1Q7KZF4 BZW1-212ENST00000464483 530 ntTSL 210.28□□□□□ -0.762e-20■■■■■ 32
SND1Q7KZF4 BZW1-203ENST00000409600 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.062e-20■■■■■ 32
SND1Q7KZF4 BZW1-207ENST00000450637 578 ntTSL 47.52□□□□□ -1.212e-20■■■■■ 32
SND1Q7KZF4 BZW1-205ENST00000419090 557 ntTSL 36.96□□□□□ -1.32e-20■■■■■ 32
SND1Q7KZF4 PPT1-202ENST00000372779 588 ntTSL 515.2■□□□□ 0.024e-8■■■■■ 32
SND1Q7KZF4 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.453e-7■■■■■ 32
SND1Q7KZF4 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.43e-7■■■■■ 32
SND1Q7KZF4 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.33e-7■■■■■ 32
SND1Q7KZF4 P4HA2-205ENST00000379104 2569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.393e-7■■■■■ 32
SND1Q7KZF4 P4HA2-204ENST00000379100 2563 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.393e-7■■■■■ 32
SND1Q7KZF4 P4HA2-207ENST00000401867 3349 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.563e-7■■■■■ 32
SND1Q7KZF4 P4HA2-203ENST00000379086 2223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.573e-7■■■■■ 32
SND1Q7KZF4 PRKCSH-202ENST00000585540 501 ntTSL 314.36□□□□□ -0.119e-13■■■■■ 32
SND1Q7KZF4 CTSS-203ENST00000472977 673 ntTSL 56.42□□□□□ -1.383e-7■■■■■ 32
SND1Q7KZF4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.85e-34■■■■■ 32
SND1Q7KZF4 CTSD-204ENST00000433655 2006 ntTSL 518.47■□□□□ 0.555e-34■■■■■ 32
SND1Q7KZF4 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.445e-34■■■■■ 32
SND1Q7KZF4 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.345e-34■■■■■ 32
SND1Q7KZF4 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.275e-34■■■■■ 32
SND1Q7KZF4 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.165e-34■■■■■ 32
SND1Q7KZF4 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.125e-34■■■■■ 32
SND1Q7KZF4 AC068580.4-203ENST00000636397 4038 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.335e-34■■■■■ 32
SND1Q7KZF4 CTSD-208ENST00000636843 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.335e-34■■■■■ 32
SND1Q7KZF4 GANAB-214ENST00000534613 737 ntTSL 516.17■□□□□ 0.185e-27■■■■■ 32
SND1Q7KZF4 AC068580.4-202ENST00000636579 350 ntTSL 315.74■□□□□ 0.117e-45■■■■■ 32
SND1Q7KZF4 PRKCSH-216ENST00000592445 598 ntTSL 220.36■□□□□ 0.859e-13■■■■■ 31.9
SND1Q7KZF4 AC068580.4-204ENST00000427721 1007 ntTSL 216.48■□□□□ 0.232e-38■■■■■ 31.9
SND1Q7KZF4 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.527e-10■■■■■ 31.9
SND1Q7KZF4 AMBP-202ENST00000466610 579 ntTSL 310.65□□□□□ -0.71e-323■■■■■ 31.8
SND1Q7KZF4 CTSS-205ENST00000483930 752 ntTSL 511.18□□□□□ -0.622e-7■■■■■ 31.8
SND1Q7KZF4 PPT1-206ENST00000526547 731 ntTSL 517.3■□□□□ 0.365e-8■■■■■ 31.8
SND1Q7KZF4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.698e-16■■■■■ 31.8
SND1Q7KZF4 ICAM1-201ENST00000264832 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.498e-16■■■■■ 31.8
SND1Q7KZF4 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.844e-9■■■■■ 31.8
SND1Q7KZF4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.414e-9■■■■■ 31.8
SND1Q7KZF4 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.084e-9■■■■■ 31.8
SND1Q7KZF4 PCOLCE-209ENST00000490909 318 ntTSL 28.68□□□□□ -1.022e-7■■■■■ 31.8
SND1Q7KZF4 CCDC47-205ENST00000582331 693 ntTSL 37.92□□□□□ -1.142e-7■■■■■ 31.7
SND1Q7KZF4 G6PC-203ENST00000588481 604 ntTSL 28.1□□□□□ -1.115e-32■■■■■ 31.7
SND1Q7KZF4 PLOD3-212ENST00000478082 1585 ntTSL 219.31■□□□□ 0.686e-8■■■■■ 31.7
SND1Q7KZF4 MANF-202ENST00000470900 1509 ntTSL 226.42■■□□□ 1.822e-6■■■■■ 31.7
SND1Q7KZF4 MANF-203ENST00000482262 436 ntTSL 25.39□□□□□ -1.552e-6■■■■■ 31.7
SND1Q7KZF4 EMC1-203ENST00000461353 2175 ntTSL 211.36□□□□□ -0.598e-9■■■■■ 31.7
SND1Q7KZF4 EMC1-208ENST00000480380 3892 ntTSL 28.35□□□□□ -1.078e-9■■■■■ 31.7
SND1Q7KZF4 ENTPD2-203ENST00000460614 1427 ntTSL 1 (best)18.33■□□□□ 0.536e-9■■■■■ 31.7
SND1Q7KZF4 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.972e-8■■■■■ 31.6
SND1Q7KZF4 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.32e-8■■■■■ 31.6
SND1Q7KZF4 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.252e-8■■■■■ 31.6
SND1Q7KZF4 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.132e-8■■■■■ 31.6
SND1Q7KZF4 SPTAN1-208ENST00000491712 714 ntTSL 213.93□□□□□ -0.182e-8■■■■■ 31.6
SND1Q7KZF4 GBA-213ENST00000493842 1020 ntTSL 513.37□□□□□ -0.272e-8■■■■■ 31.6
Retrieved 100 of 13,567 protein–RNA pairs in 174.5 ms