Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMP0

THSD4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD4Q6ZMP0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms