Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMP0

THSD4, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD4Q6ZMP0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
THSD4Q6ZMP0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
THSD4Q6ZMP0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
THSD4Q6ZMP0 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
THSD4Q6ZMP0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms