Protein–RNA interactions for Protein: Q6W4X9

MUC6, Mucin-6, humanhuman

Predictions only

Length 2,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC6Q6W4X9 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
MUC6Q6W4X9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MUC6Q6W4X9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
MUC6Q6W4X9 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
MUC6Q6W4X9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
MUC6Q6W4X9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
MUC6Q6W4X9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MUC6Q6W4X9 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
MUC6Q6W4X9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
MUC6Q6W4X9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MUC6Q6W4X9 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
MUC6Q6W4X9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
MUC6Q6W4X9 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MUC6Q6W4X9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
MUC6Q6W4X9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MUC6Q6W4X9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MUC6Q6W4X9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
MUC6Q6W4X9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
MUC6Q6W4X9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
MUC6Q6W4X9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
MUC6Q6W4X9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MUC6Q6W4X9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MUC6Q6W4X9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
MUC6Q6W4X9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MUC6Q6W4X9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
MUC6Q6W4X9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
MUC6Q6W4X9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MUC6Q6W4X9 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MUC6Q6W4X9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MUC6Q6W4X9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MUC6Q6W4X9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
MUC6Q6W4X9 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
MUC6Q6W4X9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MUC6Q6W4X9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
MUC6Q6W4X9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MUC6Q6W4X9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
MUC6Q6W4X9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
MUC6Q6W4X9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MUC6Q6W4X9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MUC6Q6W4X9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MUC6Q6W4X9 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
MUC6Q6W4X9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
MUC6Q6W4X9 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MUC6Q6W4X9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
MUC6Q6W4X9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MUC6Q6W4X9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
MUC6Q6W4X9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
MUC6Q6W4X9 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
MUC6Q6W4X9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
MUC6Q6W4X9 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MUC6Q6W4X9 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
MUC6Q6W4X9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
MUC6Q6W4X9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MUC6Q6W4X9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MUC6Q6W4X9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
MUC6Q6W4X9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
MUC6Q6W4X9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MUC6Q6W4X9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MUC6Q6W4X9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
MUC6Q6W4X9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
MUC6Q6W4X9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
MUC6Q6W4X9 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MUC6Q6W4X9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MUC6Q6W4X9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MUC6Q6W4X9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
MUC6Q6W4X9 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
MUC6Q6W4X9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MUC6Q6W4X9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MUC6Q6W4X9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
MUC6Q6W4X9 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MUC6Q6W4X9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
MUC6Q6W4X9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
MUC6Q6W4X9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MUC6Q6W4X9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
MUC6Q6W4X9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
MUC6Q6W4X9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MUC6Q6W4X9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MUC6Q6W4X9 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MUC6Q6W4X9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MUC6Q6W4X9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MUC6Q6W4X9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
MUC6Q6W4X9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
MUC6Q6W4X9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MUC6Q6W4X9 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MUC6Q6W4X9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
MUC6Q6W4X9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MUC6Q6W4X9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
MUC6Q6W4X9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MUC6Q6W4X9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
MUC6Q6W4X9 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
MUC6Q6W4X9 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
MUC6Q6W4X9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MUC6Q6W4X9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MUC6Q6W4X9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
MUC6Q6W4X9 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
MUC6Q6W4X9 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MUC6Q6W4X9 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
MUC6Q6W4X9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
MUC6Q6W4X9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
MUC6Q6W4X9 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms