Protein–RNA interactions for Protein: Q6V0L0

CYP26C1, Cytochrome P450 26C1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP26C1Q6V0L0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYP26C1Q6V0L0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CYP26C1Q6V0L0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYP26C1Q6V0L0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CYP26C1Q6V0L0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP26C1Q6V0L0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP26C1Q6V0L0 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CYP26C1Q6V0L0 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP26C1Q6V0L0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP26C1Q6V0L0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP26C1Q6V0L0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP26C1Q6V0L0 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP26C1Q6V0L0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CYP26C1Q6V0L0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYP26C1Q6V0L0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CYP26C1Q6V0L0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CYP26C1Q6V0L0 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP26C1Q6V0L0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP26C1Q6V0L0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP26C1Q6V0L0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP26C1Q6V0L0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP26C1Q6V0L0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CYP26C1Q6V0L0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CYP26C1Q6V0L0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CYP26C1Q6V0L0 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CYP26C1Q6V0L0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CYP26C1Q6V0L0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CYP26C1Q6V0L0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CYP26C1Q6V0L0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
CYP26C1Q6V0L0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CYP26C1Q6V0L0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP26C1Q6V0L0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP26C1Q6V0L0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CYP26C1Q6V0L0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYP26C1Q6V0L0 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYP26C1Q6V0L0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYP26C1Q6V0L0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYP26C1Q6V0L0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CYP26C1Q6V0L0 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP26C1Q6V0L0 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CYP26C1Q6V0L0 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CYP26C1Q6V0L0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CYP26C1Q6V0L0 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CYP26C1Q6V0L0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CYP26C1Q6V0L0 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP26C1Q6V0L0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP26C1Q6V0L0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP26C1Q6V0L0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CYP26C1Q6V0L0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CYP26C1Q6V0L0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYP26C1Q6V0L0 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CYP26C1Q6V0L0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CYP26C1Q6V0L0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP26C1Q6V0L0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP26C1Q6V0L0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP26C1Q6V0L0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP26C1Q6V0L0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP26C1Q6V0L0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP26C1Q6V0L0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CYP26C1Q6V0L0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYP26C1Q6V0L0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYP26C1Q6V0L0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYP26C1Q6V0L0 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYP26C1Q6V0L0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CYP26C1Q6V0L0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYP26C1Q6V0L0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYP26C1Q6V0L0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYP26C1Q6V0L0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYP26C1Q6V0L0 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CYP26C1Q6V0L0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CYP26C1Q6V0L0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CYP26C1Q6V0L0 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CYP26C1Q6V0L0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYP26C1Q6V0L0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CYP26C1Q6V0L0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYP26C1Q6V0L0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYP26C1Q6V0L0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYP26C1Q6V0L0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYP26C1Q6V0L0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYP26C1Q6V0L0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CYP26C1Q6V0L0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP26C1Q6V0L0 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP26C1Q6V0L0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP26C1Q6V0L0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP26C1Q6V0L0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP26C1Q6V0L0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP26C1Q6V0L0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP26C1Q6V0L0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP26C1Q6V0L0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP26C1Q6V0L0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP26C1Q6V0L0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP26C1Q6V0L0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP26C1Q6V0L0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP26C1Q6V0L0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CYP26C1Q6V0L0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYP26C1Q6V0L0 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYP26C1Q6V0L0 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYP26C1Q6V0L0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CYP26C1Q6V0L0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CYP26C1Q6V0L0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms