Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWU4

C6orf89, Bombesin receptor-activated protein C6orf89, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C6orf89Q6UWU4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C6orf89Q6UWU4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
C6orf89Q6UWU4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
C6orf89Q6UWU4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C6orf89Q6UWU4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C6orf89Q6UWU4 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C6orf89Q6UWU4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C6orf89Q6UWU4 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C6orf89Q6UWU4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
C6orf89Q6UWU4 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C6orf89Q6UWU4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
C6orf89Q6UWU4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C6orf89Q6UWU4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C6orf89Q6UWU4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C6orf89Q6UWU4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
C6orf89Q6UWU4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C6orf89Q6UWU4 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
C6orf89Q6UWU4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C6orf89Q6UWU4 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C6orf89Q6UWU4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C6orf89Q6UWU4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C6orf89Q6UWU4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C6orf89Q6UWU4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C6orf89Q6UWU4 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf89Q6UWU4 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf89Q6UWU4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf89Q6UWU4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf89Q6UWU4 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C6orf89Q6UWU4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C6orf89Q6UWU4 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C6orf89Q6UWU4 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C6orf89Q6UWU4 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C6orf89Q6UWU4 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C6orf89Q6UWU4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C6orf89Q6UWU4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C6orf89Q6UWU4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C6orf89Q6UWU4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C6orf89Q6UWU4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
C6orf89Q6UWU4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C6orf89Q6UWU4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C6orf89Q6UWU4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C6orf89Q6UWU4 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C6orf89Q6UWU4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
C6orf89Q6UWU4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C6orf89Q6UWU4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C6orf89Q6UWU4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C6orf89Q6UWU4 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C6orf89Q6UWU4 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C6orf89Q6UWU4 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C6orf89Q6UWU4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C6orf89Q6UWU4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C6orf89Q6UWU4 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C6orf89Q6UWU4 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C6orf89Q6UWU4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C6orf89Q6UWU4 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C6orf89Q6UWU4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C6orf89Q6UWU4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C6orf89Q6UWU4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C6orf89Q6UWU4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C6orf89Q6UWU4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
C6orf89Q6UWU4 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C6orf89Q6UWU4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C6orf89Q6UWU4 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C6orf89Q6UWU4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C6orf89Q6UWU4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C6orf89Q6UWU4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C6orf89Q6UWU4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C6orf89Q6UWU4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C6orf89Q6UWU4 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C6orf89Q6UWU4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C6orf89Q6UWU4 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C6orf89Q6UWU4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C6orf89Q6UWU4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C6orf89Q6UWU4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C6orf89Q6UWU4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C6orf89Q6UWU4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C6orf89Q6UWU4 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C6orf89Q6UWU4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C6orf89Q6UWU4 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C6orf89Q6UWU4 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
C6orf89Q6UWU4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C6orf89Q6UWU4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C6orf89Q6UWU4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C6orf89Q6UWU4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C6orf89Q6UWU4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C6orf89Q6UWU4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C6orf89Q6UWU4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C6orf89Q6UWU4 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C6orf89Q6UWU4 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C6orf89Q6UWU4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C6orf89Q6UWU4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C6orf89Q6UWU4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C6orf89Q6UWU4 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C6orf89Q6UWU4 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C6orf89Q6UWU4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C6orf89Q6UWU4 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C6orf89Q6UWU4 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C6orf89Q6UWU4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
C6orf89Q6UWU4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C6orf89Q6UWU4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.1 ms