Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
KLHL35Q6PF15 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL35Q6PF15 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL35Q6PF15 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL35Q6PF15 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KLHL35Q6PF15 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL35Q6PF15 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KLHL35Q6PF15 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL35Q6PF15 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL35Q6PF15 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL35Q6PF15 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL35Q6PF15 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL35Q6PF15 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KLHL35Q6PF15 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL35Q6PF15 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KLHL35Q6PF15 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KLHL35Q6PF15 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KLHL35Q6PF15 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL35Q6PF15 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL35Q6PF15 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL35Q6PF15 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL35Q6PF15 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KLHL35Q6PF15 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL35Q6PF15 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL35Q6PF15 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
KLHL35Q6PF15 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL35Q6PF15 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL35Q6PF15 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL35Q6PF15 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL35Q6PF15 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL35Q6PF15 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL35Q6PF15 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
KLHL35Q6PF15 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL35Q6PF15 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL35Q6PF15 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL35Q6PF15 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
KLHL35Q6PF15 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
KLHL35Q6PF15 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL35Q6PF15 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL35Q6PF15 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL35Q6PF15 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
KLHL35Q6PF15 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL35Q6PF15 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL35Q6PF15 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL35Q6PF15 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL35Q6PF15 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL35Q6PF15 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
KLHL35Q6PF15 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL35Q6PF15 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL35Q6PF15 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL35Q6PF15 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
KLHL35Q6PF15 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL35Q6PF15 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL35Q6PF15 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL35Q6PF15 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
KLHL35Q6PF15 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL35Q6PF15 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL35Q6PF15 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL35Q6PF15 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL35Q6PF15 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
KLHL35Q6PF15 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL35Q6PF15 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL35Q6PF15 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
KLHL35Q6PF15 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL35Q6PF15 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL35Q6PF15 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
KLHL35Q6PF15 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
KLHL35Q6PF15 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL35Q6PF15 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL35Q6PF15 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL35Q6PF15 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL35Q6PF15 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
KLHL35Q6PF15 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL35Q6PF15 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL35Q6PF15 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL35Q6PF15 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL35Q6PF15 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL35Q6PF15 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL35Q6PF15 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL35Q6PF15 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL35Q6PF15 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL35Q6PF15 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL35Q6PF15 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL35Q6PF15 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL35Q6PF15 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
KLHL35Q6PF15 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL35Q6PF15 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
KLHL35Q6PF15 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL35Q6PF15 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL35Q6PF15 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL35Q6PF15 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
KLHL35Q6PF15 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL35Q6PF15 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
KLHL35Q6PF15 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL35Q6PF15 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
KLHL35Q6PF15 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL35Q6PF15 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL35Q6PF15 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL35Q6PF15 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
KLHL35Q6PF15 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms