Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEY2

TUBA3E, Tubulin alpha-3E chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3EQ6PEY2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBA3EQ6PEY2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TUBA3EQ6PEY2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TUBA3EQ6PEY2 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBA3EQ6PEY2 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBA3EQ6PEY2 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBA3EQ6PEY2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TUBA3EQ6PEY2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBA3EQ6PEY2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBA3EQ6PEY2 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TUBA3EQ6PEY2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBA3EQ6PEY2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBA3EQ6PEY2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBA3EQ6PEY2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBA3EQ6PEY2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TUBA3EQ6PEY2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBA3EQ6PEY2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TUBA3EQ6PEY2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBA3EQ6PEY2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBA3EQ6PEY2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TUBA3EQ6PEY2 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
TUBA3EQ6PEY2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBA3EQ6PEY2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TUBA3EQ6PEY2 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBA3EQ6PEY2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBA3EQ6PEY2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBA3EQ6PEY2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TUBA3EQ6PEY2 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBA3EQ6PEY2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBA3EQ6PEY2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TUBA3EQ6PEY2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBA3EQ6PEY2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBA3EQ6PEY2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBA3EQ6PEY2 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBA3EQ6PEY2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
TUBA3EQ6PEY2 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBA3EQ6PEY2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBA3EQ6PEY2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBA3EQ6PEY2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBA3EQ6PEY2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBA3EQ6PEY2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBA3EQ6PEY2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TUBA3EQ6PEY2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBA3EQ6PEY2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBA3EQ6PEY2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TUBA3EQ6PEY2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBA3EQ6PEY2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBA3EQ6PEY2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBA3EQ6PEY2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TUBA3EQ6PEY2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBA3EQ6PEY2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBA3EQ6PEY2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBA3EQ6PEY2 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBA3EQ6PEY2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TUBA3EQ6PEY2 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBA3EQ6PEY2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBA3EQ6PEY2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBA3EQ6PEY2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBA3EQ6PEY2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBA3EQ6PEY2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBA3EQ6PEY2 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBA3EQ6PEY2 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TUBA3EQ6PEY2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBA3EQ6PEY2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBA3EQ6PEY2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBA3EQ6PEY2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBA3EQ6PEY2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBA3EQ6PEY2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TUBA3EQ6PEY2 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TUBA3EQ6PEY2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TUBA3EQ6PEY2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
TUBA3EQ6PEY2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBA3EQ6PEY2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBA3EQ6PEY2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBA3EQ6PEY2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBA3EQ6PEY2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBA3EQ6PEY2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TUBA3EQ6PEY2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBA3EQ6PEY2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBA3EQ6PEY2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TUBA3EQ6PEY2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBA3EQ6PEY2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBA3EQ6PEY2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBA3EQ6PEY2 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TUBA3EQ6PEY2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBA3EQ6PEY2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBA3EQ6PEY2 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TUBA3EQ6PEY2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBA3EQ6PEY2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBA3EQ6PEY2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBA3EQ6PEY2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBA3EQ6PEY2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TUBA3EQ6PEY2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBA3EQ6PEY2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBA3EQ6PEY2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TUBA3EQ6PEY2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
TUBA3EQ6PEY2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TUBA3EQ6PEY2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms