Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXS1

PPP1R2P3, Protein phosphatase inhibitor 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R2P3Q6NXS1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPP1R2P3Q6NXS1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
PPP1R2P3Q6NXS1 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPP1R2P3Q6NXS1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PPP1R2P3Q6NXS1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPP1R2P3Q6NXS1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPP1R2P3Q6NXS1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PPP1R2P3Q6NXS1 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPP1R2P3Q6NXS1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPP1R2P3Q6NXS1 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PPP1R2P3Q6NXS1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPP1R2P3Q6NXS1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PPP1R2P3Q6NXS1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPP1R2P3Q6NXS1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPP1R2P3Q6NXS1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPP1R2P3Q6NXS1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPP1R2P3Q6NXS1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPP1R2P3Q6NXS1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PPP1R2P3Q6NXS1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PPP1R2P3Q6NXS1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PPP1R2P3Q6NXS1 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPP1R2P3Q6NXS1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PPP1R2P3Q6NXS1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PPP1R2P3Q6NXS1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP1R2P3Q6NXS1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP1R2P3Q6NXS1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP1R2P3Q6NXS1 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP1R2P3Q6NXS1 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP1R2P3Q6NXS1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PPP1R2P3Q6NXS1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP1R2P3Q6NXS1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP1R2P3Q6NXS1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP1R2P3Q6NXS1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP1R2P3Q6NXS1 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PPP1R2P3Q6NXS1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1R2P3Q6NXS1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1R2P3Q6NXS1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1R2P3Q6NXS1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1R2P3Q6NXS1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1R2P3Q6NXS1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1R2P3Q6NXS1 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1R2P3Q6NXS1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PPP1R2P3Q6NXS1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPP1R2P3Q6NXS1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPP1R2P3Q6NXS1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PPP1R2P3Q6NXS1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP1R2P3Q6NXS1 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP1R2P3Q6NXS1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP1R2P3Q6NXS1 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP1R2P3Q6NXS1 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP1R2P3Q6NXS1 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PPP1R2P3Q6NXS1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R2P3Q6NXS1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PPP1R2P3Q6NXS1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R2P3Q6NXS1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R2P3Q6NXS1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R2P3Q6NXS1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R2P3Q6NXS1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PPP1R2P3Q6NXS1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP1R2P3Q6NXS1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP1R2P3Q6NXS1 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP1R2P3Q6NXS1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PPP1R2P3Q6NXS1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP1R2P3Q6NXS1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP1R2P3Q6NXS1 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PPP1R2P3Q6NXS1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PPP1R2P3Q6NXS1 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPP1R2P3Q6NXS1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPP1R2P3Q6NXS1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
PPP1R2P3Q6NXS1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP1R2P3Q6NXS1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP1R2P3Q6NXS1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP1R2P3Q6NXS1 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PPP1R2P3Q6NXS1 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPP1R2P3Q6NXS1 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPP1R2P3Q6NXS1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PPP1R2P3Q6NXS1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PPP1R2P3Q6NXS1 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPP1R2P3Q6NXS1 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPP1R2P3Q6NXS1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PPP1R2P3Q6NXS1 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PPP1R2P3Q6NXS1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP1R2P3Q6NXS1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP1R2P3Q6NXS1 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP1R2P3Q6NXS1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP1R2P3Q6NXS1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP1R2P3Q6NXS1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PPP1R2P3Q6NXS1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPP1R2P3Q6NXS1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPP1R2P3Q6NXS1 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPP1R2P3Q6NXS1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPP1R2P3Q6NXS1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PPP1R2P3Q6NXS1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPP1R2P3Q6NXS1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPP1R2P3Q6NXS1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPP1R2P3Q6NXS1 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPP1R2P3Q6NXS1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPP1R2P3Q6NXS1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PPP1R2P3Q6NXS1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PPP1R2P3Q6NXS1 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms