Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW34

NEPRO, Nucleolus and neural progenitor protein, humanhuman

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEPROQ6NW34 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEPROQ6NW34 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEPROQ6NW34 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NEPROQ6NW34 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEPROQ6NW34 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEPROQ6NW34 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEPROQ6NW34 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NEPROQ6NW34 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NEPROQ6NW34 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEPROQ6NW34 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEPROQ6NW34 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEPROQ6NW34 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NEPROQ6NW34 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEPROQ6NW34 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEPROQ6NW34 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEPROQ6NW34 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEPROQ6NW34 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEPROQ6NW34 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NEPROQ6NW34 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEPROQ6NW34 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NEPROQ6NW34 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEPROQ6NW34 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEPROQ6NW34 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEPROQ6NW34 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEPROQ6NW34 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NEPROQ6NW34 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEPROQ6NW34 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEPROQ6NW34 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEPROQ6NW34 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEPROQ6NW34 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEPROQ6NW34 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEPROQ6NW34 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NEPROQ6NW34 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEPROQ6NW34 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEPROQ6NW34 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NEPROQ6NW34 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NEPROQ6NW34 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEPROQ6NW34 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NEPROQ6NW34 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NEPROQ6NW34 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NEPROQ6NW34 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEPROQ6NW34 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NEPROQ6NW34 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEPROQ6NW34 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
NEPROQ6NW34 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NEPROQ6NW34 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEPROQ6NW34 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEPROQ6NW34 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NEPROQ6NW34 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEPROQ6NW34 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEPROQ6NW34 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NEPROQ6NW34 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEPROQ6NW34 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEPROQ6NW34 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEPROQ6NW34 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEPROQ6NW34 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEPROQ6NW34 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEPROQ6NW34 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NEPROQ6NW34 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NEPROQ6NW34 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEPROQ6NW34 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEPROQ6NW34 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NEPROQ6NW34 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEPROQ6NW34 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NEPROQ6NW34 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEPROQ6NW34 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEPROQ6NW34 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEPROQ6NW34 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEPROQ6NW34 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEPROQ6NW34 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NEPROQ6NW34 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEPROQ6NW34 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEPROQ6NW34 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NEPROQ6NW34 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEPROQ6NW34 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEPROQ6NW34 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NEPROQ6NW34 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEPROQ6NW34 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEPROQ6NW34 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEPROQ6NW34 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEPROQ6NW34 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEPROQ6NW34 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEPROQ6NW34 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEPROQ6NW34 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NEPROQ6NW34 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEPROQ6NW34 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEPROQ6NW34 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NEPROQ6NW34 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NEPROQ6NW34 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEPROQ6NW34 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEPROQ6NW34 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEPROQ6NW34 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NEPROQ6NW34 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEPROQ6NW34 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEPROQ6NW34 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEPROQ6NW34 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEPROQ6NW34 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEPROQ6NW34 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NEPROQ6NW34 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NEPROQ6NW34 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.7 ms