Protein–RNA interactions for Protein: Q6ISB3

GRHL2, Grainyhead-like protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRHL2Q6ISB3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRHL2Q6ISB3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRHL2Q6ISB3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRHL2Q6ISB3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRHL2Q6ISB3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRHL2Q6ISB3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
GRHL2Q6ISB3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
GRHL2Q6ISB3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
GRHL2Q6ISB3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRHL2Q6ISB3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRHL2Q6ISB3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRHL2Q6ISB3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRHL2Q6ISB3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
GRHL2Q6ISB3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRHL2Q6ISB3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRHL2Q6ISB3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRHL2Q6ISB3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRHL2Q6ISB3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
GRHL2Q6ISB3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRHL2Q6ISB3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
GRHL2Q6ISB3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRHL2Q6ISB3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRHL2Q6ISB3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRHL2Q6ISB3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRHL2Q6ISB3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRHL2Q6ISB3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRHL2Q6ISB3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRHL2Q6ISB3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRHL2Q6ISB3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRHL2Q6ISB3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
GRHL2Q6ISB3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRHL2Q6ISB3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRHL2Q6ISB3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRHL2Q6ISB3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRHL2Q6ISB3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRHL2Q6ISB3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRHL2Q6ISB3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRHL2Q6ISB3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRHL2Q6ISB3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRHL2Q6ISB3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRHL2Q6ISB3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRHL2Q6ISB3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRHL2Q6ISB3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRHL2Q6ISB3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRHL2Q6ISB3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRHL2Q6ISB3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRHL2Q6ISB3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRHL2Q6ISB3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRHL2Q6ISB3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRHL2Q6ISB3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRHL2Q6ISB3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRHL2Q6ISB3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRHL2Q6ISB3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRHL2Q6ISB3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRHL2Q6ISB3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRHL2Q6ISB3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRHL2Q6ISB3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRHL2Q6ISB3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRHL2Q6ISB3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GRHL2Q6ISB3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GRHL2Q6ISB3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
GRHL2Q6ISB3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRHL2Q6ISB3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GRHL2Q6ISB3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRHL2Q6ISB3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRHL2Q6ISB3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRHL2Q6ISB3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRHL2Q6ISB3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRHL2Q6ISB3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GRHL2Q6ISB3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRHL2Q6ISB3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GRHL2Q6ISB3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRHL2Q6ISB3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GRHL2Q6ISB3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRHL2Q6ISB3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRHL2Q6ISB3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRHL2Q6ISB3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRHL2Q6ISB3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRHL2Q6ISB3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRHL2Q6ISB3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GRHL2Q6ISB3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GRHL2Q6ISB3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRHL2Q6ISB3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GRHL2Q6ISB3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GRHL2Q6ISB3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRHL2Q6ISB3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRHL2Q6ISB3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRHL2Q6ISB3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GRHL2Q6ISB3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRHL2Q6ISB3 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRHL2Q6ISB3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRHL2Q6ISB3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRHL2Q6ISB3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRHL2Q6ISB3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRHL2Q6ISB3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRHL2Q6ISB3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRHL2Q6ISB3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRHL2Q6ISB3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRHL2Q6ISB3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRHL2Q6ISB3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms