Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYK3

ECM29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM29Q5VYK3 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
ECM29Q5VYK3 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
ECM29Q5VYK3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ECM29Q5VYK3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ECM29Q5VYK3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ECM29Q5VYK3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
ECM29Q5VYK3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ECM29Q5VYK3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ECM29Q5VYK3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
ECM29Q5VYK3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ECM29Q5VYK3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ECM29Q5VYK3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
ECM29Q5VYK3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ECM29Q5VYK3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ECM29Q5VYK3 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
ECM29Q5VYK3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
ECM29Q5VYK3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ECM29Q5VYK3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ECM29Q5VYK3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
ECM29Q5VYK3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ECM29Q5VYK3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ECM29Q5VYK3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
ECM29Q5VYK3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ECM29Q5VYK3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
ECM29Q5VYK3 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
ECM29Q5VYK3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
ECM29Q5VYK3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ECM29Q5VYK3 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
ECM29Q5VYK3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ECM29Q5VYK3 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ECM29Q5VYK3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
ECM29Q5VYK3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ECM29Q5VYK3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
ECM29Q5VYK3 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.79■■■□□ 2.52
ECM29Q5VYK3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
ECM29Q5VYK3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ECM29Q5VYK3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ECM29Q5VYK3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ECM29Q5VYK3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.77■■■□□ 2.52
ECM29Q5VYK3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ECM29Q5VYK3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ECM29Q5VYK3 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
ECM29Q5VYK3 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
ECM29Q5VYK3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
ECM29Q5VYK3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ECM29Q5VYK3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ECM29Q5VYK3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ECM29Q5VYK3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ECM29Q5VYK3 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
ECM29Q5VYK3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
ECM29Q5VYK3 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ECM29Q5VYK3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ECM29Q5VYK3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
ECM29Q5VYK3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
ECM29Q5VYK3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ECM29Q5VYK3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ECM29Q5VYK3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ECM29Q5VYK3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ECM29Q5VYK3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ECM29Q5VYK3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ECM29Q5VYK3 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
ECM29Q5VYK3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
ECM29Q5VYK3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ECM29Q5VYK3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ECM29Q5VYK3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.71■■■□□ 2.51
ECM29Q5VYK3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
ECM29Q5VYK3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
ECM29Q5VYK3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
ECM29Q5VYK3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ECM29Q5VYK3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ECM29Q5VYK3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
ECM29Q5VYK3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ECM29Q5VYK3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ECM29Q5VYK3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
ECM29Q5VYK3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
ECM29Q5VYK3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.68■■■□□ 2.5
ECM29Q5VYK3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ECM29Q5VYK3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ECM29Q5VYK3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
ECM29Q5VYK3 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
ECM29Q5VYK3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
ECM29Q5VYK3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ECM29Q5VYK3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ECM29Q5VYK3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
ECM29Q5VYK3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
ECM29Q5VYK3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ECM29Q5VYK3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
ECM29Q5VYK3 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ECM29Q5VYK3 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
ECM29Q5VYK3 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
ECM29Q5VYK3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ECM29Q5VYK3 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
ECM29Q5VYK3 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
ECM29Q5VYK3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
ECM29Q5VYK3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ECM29Q5VYK3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
ECM29Q5VYK3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ECM29Q5VYK3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ECM29Q5VYK3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
ECM29Q5VYK3 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 296.8 ms