Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM5

PRAMEF9, PRAME family member 9/15, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF9Q5VWM5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF9Q5VWM5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF9Q5VWM5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PRAMEF9Q5VWM5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF9Q5VWM5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF9Q5VWM5 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PRAMEF9Q5VWM5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF9Q5VWM5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF9Q5VWM5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF9Q5VWM5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF9Q5VWM5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF9Q5VWM5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRAMEF9Q5VWM5 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRAMEF9Q5VWM5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF9Q5VWM5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF9Q5VWM5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF9Q5VWM5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF9Q5VWM5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF9Q5VWM5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF9Q5VWM5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF9Q5VWM5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF9Q5VWM5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRAMEF9Q5VWM5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF9Q5VWM5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF9Q5VWM5 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF9Q5VWM5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF9Q5VWM5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRAMEF9Q5VWM5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF9Q5VWM5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF9Q5VWM5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF9Q5VWM5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRAMEF9Q5VWM5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF9Q5VWM5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF9Q5VWM5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF9Q5VWM5 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF9Q5VWM5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRAMEF9Q5VWM5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF9Q5VWM5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF9Q5VWM5 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF9Q5VWM5 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRAMEF9Q5VWM5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF9Q5VWM5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRAMEF9Q5VWM5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRAMEF9Q5VWM5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF9Q5VWM5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF9Q5VWM5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF9Q5VWM5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRAMEF9Q5VWM5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF9Q5VWM5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF9Q5VWM5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF9Q5VWM5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRAMEF9Q5VWM5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF9Q5VWM5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRAMEF9Q5VWM5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF9Q5VWM5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF9Q5VWM5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRAMEF9Q5VWM5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF9Q5VWM5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF9Q5VWM5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRAMEF9Q5VWM5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF9Q5VWM5 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRAMEF9Q5VWM5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
PRAMEF9Q5VWM5 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAMEF9Q5VWM5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAMEF9Q5VWM5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAMEF9Q5VWM5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRAMEF9Q5VWM5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF9Q5VWM5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF9Q5VWM5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF9Q5VWM5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRAMEF9Q5VWM5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF9Q5VWM5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRAMEF9Q5VWM5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF9Q5VWM5 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF9Q5VWM5 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF9Q5VWM5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF9Q5VWM5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF9Q5VWM5 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF9Q5VWM5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF9Q5VWM5 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF9Q5VWM5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRAMEF9Q5VWM5 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF9Q5VWM5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF9Q5VWM5 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRAMEF9Q5VWM5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF9Q5VWM5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF9Q5VWM5 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF9Q5VWM5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF9Q5VWM5 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF9Q5VWM5 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRAMEF9Q5VWM5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF9Q5VWM5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF9Q5VWM5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF9Q5VWM5 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRAMEF9Q5VWM5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRAMEF9Q5VWM5 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF9Q5VWM5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF9Q5VWM5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF9Q5VWM5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRAMEF9Q5VWM5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms