Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRPF38BQ5VTL8 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRPF38BQ5VTL8 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRPF38BQ5VTL8 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PRPF38BQ5VTL8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PRPF38BQ5VTL8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRPF38BQ5VTL8 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRPF38BQ5VTL8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRPF38BQ5VTL8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRPF38BQ5VTL8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRPF38BQ5VTL8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PRPF38BQ5VTL8 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PRPF38BQ5VTL8 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRPF38BQ5VTL8 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PRPF38BQ5VTL8 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PRPF38BQ5VTL8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PRPF38BQ5VTL8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PRPF38BQ5VTL8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRPF38BQ5VTL8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRPF38BQ5VTL8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PRPF38BQ5VTL8 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
PRPF38BQ5VTL8 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PRPF38BQ5VTL8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRPF38BQ5VTL8 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRPF38BQ5VTL8 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PRPF38BQ5VTL8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRPF38BQ5VTL8 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PRPF38BQ5VTL8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRPF38BQ5VTL8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRPF38BQ5VTL8 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRPF38BQ5VTL8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PRPF38BQ5VTL8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PRPF38BQ5VTL8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PRPF38BQ5VTL8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRPF38BQ5VTL8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF38BQ5VTL8 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF38BQ5VTL8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF38BQ5VTL8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF38BQ5VTL8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRPF38BQ5VTL8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF38BQ5VTL8 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF38BQ5VTL8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF38BQ5VTL8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF38BQ5VTL8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRPF38BQ5VTL8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRPF38BQ5VTL8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRPF38BQ5VTL8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRPF38BQ5VTL8 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRPF38BQ5VTL8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRPF38BQ5VTL8 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRPF38BQ5VTL8 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRPF38BQ5VTL8 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPF38BQ5VTL8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPF38BQ5VTL8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPF38BQ5VTL8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPF38BQ5VTL8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPF38BQ5VTL8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPF38BQ5VTL8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPF38BQ5VTL8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRPF38BQ5VTL8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRPF38BQ5VTL8 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF38BQ5VTL8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PRPF38BQ5VTL8 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF38BQ5VTL8 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF38BQ5VTL8 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF38BQ5VTL8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF38BQ5VTL8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF38BQ5VTL8 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF38BQ5VTL8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRPF38BQ5VTL8 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRPF38BQ5VTL8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRPF38BQ5VTL8 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF38BQ5VTL8 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF38BQ5VTL8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF38BQ5VTL8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRPF38BQ5VTL8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRPF38BQ5VTL8 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRPF38BQ5VTL8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRPF38BQ5VTL8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRPF38BQ5VTL8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PRPF38BQ5VTL8 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRPF38BQ5VTL8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRPF38BQ5VTL8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRPF38BQ5VTL8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRPF38BQ5VTL8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF38BQ5VTL8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF38BQ5VTL8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF38BQ5VTL8 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF38BQ5VTL8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF38BQ5VTL8 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF38BQ5VTL8 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF38BQ5VTL8 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRPF38BQ5VTL8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRPF38BQ5VTL8 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRPF38BQ5VTL8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRPF38BQ5VTL8 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPF38BQ5VTL8 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPF38BQ5VTL8 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPF38BQ5VTL8 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
PRPF38BQ5VTL8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms