Protein–RNA interactions for Protein: Q5TG30

ARHGAP40, Rho GTPase-activating protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP40Q5TG30 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP40Q5TG30 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ARHGAP40Q5TG30 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP40Q5TG30 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP40Q5TG30 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ARHGAP40Q5TG30 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP40Q5TG30 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ARHGAP40Q5TG30 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP40Q5TG30 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ARHGAP40Q5TG30 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ARHGAP40Q5TG30 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGAP40Q5TG30 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ARHGAP40Q5TG30 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP40Q5TG30 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP40Q5TG30 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP40Q5TG30 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ARHGAP40Q5TG30 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP40Q5TG30 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP40Q5TG30 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP40Q5TG30 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP40Q5TG30 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP40Q5TG30 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ARHGAP40Q5TG30 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGAP40Q5TG30 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGAP40Q5TG30 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGAP40Q5TG30 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGAP40Q5TG30 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGAP40Q5TG30 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ARHGAP40Q5TG30 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGAP40Q5TG30 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGAP40Q5TG30 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGAP40Q5TG30 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARHGAP40Q5TG30 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGAP40Q5TG30 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGAP40Q5TG30 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARHGAP40Q5TG30 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGAP40Q5TG30 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARHGAP40Q5TG30 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP40Q5TG30 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ARHGAP40Q5TG30 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP40Q5TG30 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP40Q5TG30 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP40Q5TG30 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARHGAP40Q5TG30 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP40Q5TG30 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP40Q5TG30 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARHGAP40Q5TG30 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARHGAP40Q5TG30 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARHGAP40Q5TG30 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP40Q5TG30 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP40Q5TG30 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP40Q5TG30 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP40Q5TG30 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARHGAP40Q5TG30 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP40Q5TG30 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP40Q5TG30 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARHGAP40Q5TG30 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP40Q5TG30 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP40Q5TG30 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGAP40Q5TG30 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP40Q5TG30 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP40Q5TG30 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP40Q5TG30 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP40Q5TG30 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGAP40Q5TG30 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP40Q5TG30 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP40Q5TG30 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGAP40Q5TG30 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP40Q5TG30 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP40Q5TG30 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP40Q5TG30 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP40Q5TG30 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP40Q5TG30 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP40Q5TG30 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP40Q5TG30 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGAP40Q5TG30 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP40Q5TG30 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP40Q5TG30 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP40Q5TG30 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP40Q5TG30 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP40Q5TG30 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP40Q5TG30 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP40Q5TG30 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGAP40Q5TG30 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARHGAP40Q5TG30 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP40Q5TG30 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP40Q5TG30 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP40Q5TG30 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGAP40Q5TG30 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP40Q5TG30 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP40Q5TG30 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP40Q5TG30 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGAP40Q5TG30 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP40Q5TG30 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP40Q5TG30 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP40Q5TG30 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP40Q5TG30 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP40Q5TG30 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP40Q5TG30 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGAP40Q5TG30 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 192 ms