Protein–RNA interactions for Protein: Q5T9A4

ATAD3B, ATPase family AAA domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3BQ5T9A4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATAD3BQ5T9A4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATAD3BQ5T9A4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
ATAD3BQ5T9A4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATAD3BQ5T9A4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
ATAD3BQ5T9A4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATAD3BQ5T9A4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATAD3BQ5T9A4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATAD3BQ5T9A4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATAD3BQ5T9A4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATAD3BQ5T9A4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ATAD3BQ5T9A4 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ATAD3BQ5T9A4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATAD3BQ5T9A4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATAD3BQ5T9A4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATAD3BQ5T9A4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATAD3BQ5T9A4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ATAD3BQ5T9A4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ATAD3BQ5T9A4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATAD3BQ5T9A4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATAD3BQ5T9A4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ATAD3BQ5T9A4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATAD3BQ5T9A4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATAD3BQ5T9A4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATAD3BQ5T9A4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ATAD3BQ5T9A4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATAD3BQ5T9A4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
ATAD3BQ5T9A4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ATAD3BQ5T9A4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ATAD3BQ5T9A4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATAD3BQ5T9A4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATAD3BQ5T9A4 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATAD3BQ5T9A4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ATAD3BQ5T9A4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ATAD3BQ5T9A4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ATAD3BQ5T9A4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATAD3BQ5T9A4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATAD3BQ5T9A4 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATAD3BQ5T9A4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATAD3BQ5T9A4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATAD3BQ5T9A4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATAD3BQ5T9A4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATAD3BQ5T9A4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATAD3BQ5T9A4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATAD3BQ5T9A4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATAD3BQ5T9A4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATAD3BQ5T9A4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATAD3BQ5T9A4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATAD3BQ5T9A4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATAD3BQ5T9A4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATAD3BQ5T9A4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATAD3BQ5T9A4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATAD3BQ5T9A4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATAD3BQ5T9A4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATAD3BQ5T9A4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATAD3BQ5T9A4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATAD3BQ5T9A4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATAD3BQ5T9A4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATAD3BQ5T9A4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATAD3BQ5T9A4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATAD3BQ5T9A4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATAD3BQ5T9A4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATAD3BQ5T9A4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATAD3BQ5T9A4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATAD3BQ5T9A4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATAD3BQ5T9A4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATAD3BQ5T9A4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATAD3BQ5T9A4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATAD3BQ5T9A4 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATAD3BQ5T9A4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATAD3BQ5T9A4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATAD3BQ5T9A4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATAD3BQ5T9A4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATAD3BQ5T9A4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATAD3BQ5T9A4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATAD3BQ5T9A4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATAD3BQ5T9A4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATAD3BQ5T9A4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATAD3BQ5T9A4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATAD3BQ5T9A4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATAD3BQ5T9A4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATAD3BQ5T9A4 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATAD3BQ5T9A4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATAD3BQ5T9A4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATAD3BQ5T9A4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATAD3BQ5T9A4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATAD3BQ5T9A4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATAD3BQ5T9A4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATAD3BQ5T9A4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATAD3BQ5T9A4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATAD3BQ5T9A4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATAD3BQ5T9A4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATAD3BQ5T9A4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATAD3BQ5T9A4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ATAD3BQ5T9A4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATAD3BQ5T9A4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATAD3BQ5T9A4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATAD3BQ5T9A4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATAD3BQ5T9A4 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ATAD3BQ5T9A4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms