Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2D3

OTUD3, OTU domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD3Q5T2D3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD3Q5T2D3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD3Q5T2D3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
OTUD3Q5T2D3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTUD3Q5T2D3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTUD3Q5T2D3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
OTUD3Q5T2D3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD3Q5T2D3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD3Q5T2D3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
OTUD3Q5T2D3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUD3Q5T2D3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUD3Q5T2D3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
OTUD3Q5T2D3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD3Q5T2D3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD3Q5T2D3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD3Q5T2D3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD3Q5T2D3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD3Q5T2D3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD3Q5T2D3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD3Q5T2D3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD3Q5T2D3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD3Q5T2D3 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
OTUD3Q5T2D3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUD3Q5T2D3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUD3Q5T2D3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUD3Q5T2D3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUD3Q5T2D3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
OTUD3Q5T2D3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD3Q5T2D3 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD3Q5T2D3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD3Q5T2D3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
OTUD3Q5T2D3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUD3Q5T2D3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
OTUD3Q5T2D3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUD3Q5T2D3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUD3Q5T2D3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUD3Q5T2D3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
OTUD3Q5T2D3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUD3Q5T2D3 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUD3Q5T2D3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
OTUD3Q5T2D3 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD3Q5T2D3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD3Q5T2D3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD3Q5T2D3 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD3Q5T2D3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD3Q5T2D3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD3Q5T2D3 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
OTUD3Q5T2D3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUD3Q5T2D3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUD3Q5T2D3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUD3Q5T2D3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
OTUD3Q5T2D3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
OTUD3Q5T2D3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTUD3Q5T2D3 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTUD3Q5T2D3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTUD3Q5T2D3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
OTUD3Q5T2D3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUD3Q5T2D3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUD3Q5T2D3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUD3Q5T2D3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUD3Q5T2D3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUD3Q5T2D3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUD3Q5T2D3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUD3Q5T2D3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
OTUD3Q5T2D3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUD3Q5T2D3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUD3Q5T2D3 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
OTUD3Q5T2D3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUD3Q5T2D3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUD3Q5T2D3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUD3Q5T2D3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUD3Q5T2D3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUD3Q5T2D3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
OTUD3Q5T2D3 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUD3Q5T2D3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUD3Q5T2D3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUD3Q5T2D3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUD3Q5T2D3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUD3Q5T2D3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
OTUD3Q5T2D3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTUD3Q5T2D3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTUD3Q5T2D3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTUD3Q5T2D3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTUD3Q5T2D3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTUD3Q5T2D3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
OTUD3Q5T2D3 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
OTUD3Q5T2D3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
OTUD3Q5T2D3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
OTUD3Q5T2D3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
OTUD3Q5T2D3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTUD3Q5T2D3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTUD3Q5T2D3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTUD3Q5T2D3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTUD3Q5T2D3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTUD3Q5T2D3 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
OTUD3Q5T2D3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUD3Q5T2D3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUD3Q5T2D3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
OTUD3Q5T2D3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
OTUD3Q5T2D3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms