Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWX8

ODR4, Protein odr-4 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODR4Q5SWX8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ODR4Q5SWX8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ODR4Q5SWX8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ODR4Q5SWX8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ODR4Q5SWX8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ODR4Q5SWX8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ODR4Q5SWX8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ODR4Q5SWX8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ODR4Q5SWX8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ODR4Q5SWX8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ODR4Q5SWX8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ODR4Q5SWX8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ODR4Q5SWX8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ODR4Q5SWX8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ODR4Q5SWX8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ODR4Q5SWX8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ODR4Q5SWX8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ODR4Q5SWX8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ODR4Q5SWX8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ODR4Q5SWX8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ODR4Q5SWX8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ODR4Q5SWX8 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ODR4Q5SWX8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ODR4Q5SWX8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ODR4Q5SWX8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ODR4Q5SWX8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ODR4Q5SWX8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ODR4Q5SWX8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ODR4Q5SWX8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ODR4Q5SWX8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ODR4Q5SWX8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ODR4Q5SWX8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ODR4Q5SWX8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ODR4Q5SWX8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ODR4Q5SWX8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ODR4Q5SWX8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ODR4Q5SWX8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ODR4Q5SWX8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ODR4Q5SWX8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ODR4Q5SWX8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ODR4Q5SWX8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ODR4Q5SWX8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ODR4Q5SWX8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ODR4Q5SWX8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ODR4Q5SWX8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ODR4Q5SWX8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ODR4Q5SWX8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ODR4Q5SWX8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ODR4Q5SWX8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ODR4Q5SWX8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ODR4Q5SWX8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ODR4Q5SWX8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ODR4Q5SWX8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.12
ODR4Q5SWX8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ODR4Q5SWX8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ODR4Q5SWX8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ODR4Q5SWX8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ODR4Q5SWX8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ODR4Q5SWX8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ODR4Q5SWX8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ODR4Q5SWX8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ODR4Q5SWX8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ODR4Q5SWX8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ODR4Q5SWX8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ODR4Q5SWX8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ODR4Q5SWX8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ODR4Q5SWX8 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ODR4Q5SWX8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ODR4Q5SWX8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ODR4Q5SWX8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ODR4Q5SWX8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ODR4Q5SWX8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ODR4Q5SWX8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ODR4Q5SWX8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ODR4Q5SWX8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ODR4Q5SWX8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ODR4Q5SWX8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ODR4Q5SWX8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ODR4Q5SWX8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ODR4Q5SWX8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ODR4Q5SWX8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ODR4Q5SWX8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
ODR4Q5SWX8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ODR4Q5SWX8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ODR4Q5SWX8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ODR4Q5SWX8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ODR4Q5SWX8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ODR4Q5SWX8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ODR4Q5SWX8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ODR4Q5SWX8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ODR4Q5SWX8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ODR4Q5SWX8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ODR4Q5SWX8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ODR4Q5SWX8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ODR4Q5SWX8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
ODR4Q5SWX8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ODR4Q5SWX8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ODR4Q5SWX8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ODR4Q5SWX8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ODR4Q5SWX8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms