Protein–RNA interactions for Protein: Q5JUK3

KCNT1, Potassium channel subfamily T member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNT1Q5JUK3 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNT1Q5JUK3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNT1Q5JUK3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNT1Q5JUK3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KCNT1Q5JUK3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNT1Q5JUK3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNT1Q5JUK3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KCNT1Q5JUK3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNT1Q5JUK3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNT1Q5JUK3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNT1Q5JUK3 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNT1Q5JUK3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNT1Q5JUK3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNT1Q5JUK3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KCNT1Q5JUK3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNT1Q5JUK3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNT1Q5JUK3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNT1Q5JUK3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNT1Q5JUK3 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNT1Q5JUK3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KCNT1Q5JUK3 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNT1Q5JUK3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNT1Q5JUK3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNT1Q5JUK3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KCNT1Q5JUK3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNT1Q5JUK3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNT1Q5JUK3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
KCNT1Q5JUK3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCNT1Q5JUK3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KCNT1Q5JUK3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNT1Q5JUK3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNT1Q5JUK3 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KCNT1Q5JUK3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KCNT1Q5JUK3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
KCNT1Q5JUK3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNT1Q5JUK3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNT1Q5JUK3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNT1Q5JUK3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
KCNT1Q5JUK3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNT1Q5JUK3 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
KCNT1Q5JUK3 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNT1Q5JUK3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNT1Q5JUK3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNT1Q5JUK3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNT1Q5JUK3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KCNT1Q5JUK3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNT1Q5JUK3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNT1Q5JUK3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNT1Q5JUK3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNT1Q5JUK3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNT1Q5JUK3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNT1Q5JUK3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNT1Q5JUK3 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KCNT1Q5JUK3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNT1Q5JUK3 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNT1Q5JUK3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNT1Q5JUK3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNT1Q5JUK3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNT1Q5JUK3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
KCNT1Q5JUK3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNT1Q5JUK3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNT1Q5JUK3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KCNT1Q5JUK3 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
KCNT1Q5JUK3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNT1Q5JUK3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNT1Q5JUK3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KCNT1Q5JUK3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
KCNT1Q5JUK3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNT1Q5JUK3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNT1Q5JUK3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNT1Q5JUK3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
KCNT1Q5JUK3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
KCNT1Q5JUK3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNT1Q5JUK3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNT1Q5JUK3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNT1Q5JUK3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
KCNT1Q5JUK3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNT1Q5JUK3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNT1Q5JUK3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNT1Q5JUK3 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNT1Q5JUK3 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNT1Q5JUK3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNT1Q5JUK3 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
KCNT1Q5JUK3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCNT1Q5JUK3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
KCNT1Q5JUK3 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
KCNT1Q5JUK3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCNT1Q5JUK3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCNT1Q5JUK3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCNT1Q5JUK3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCNT1Q5JUK3 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
KCNT1Q5JUK3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNT1Q5JUK3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNT1Q5JUK3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
KCNT1Q5JUK3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNT1Q5JUK3 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNT1Q5JUK3 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNT1Q5JUK3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
KCNT1Q5JUK3 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
KCNT1Q5JUK3 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms