Protein–RNA interactions for Protein: Q5JU00

TCTE1, T-complex-associated testis-expressed protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCTE1Q5JU00 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TCTE1Q5JU00 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCTE1Q5JU00 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TCTE1Q5JU00 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TCTE1Q5JU00 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCTE1Q5JU00 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCTE1Q5JU00 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCTE1Q5JU00 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCTE1Q5JU00 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TCTE1Q5JU00 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TCTE1Q5JU00 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCTE1Q5JU00 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCTE1Q5JU00 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TCTE1Q5JU00 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCTE1Q5JU00 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCTE1Q5JU00 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCTE1Q5JU00 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TCTE1Q5JU00 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TCTE1Q5JU00 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TCTE1Q5JU00 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TCTE1Q5JU00 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCTE1Q5JU00 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCTE1Q5JU00 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCTE1Q5JU00 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCTE1Q5JU00 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TCTE1Q5JU00 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCTE1Q5JU00 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TCTE1Q5JU00 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCTE1Q5JU00 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCTE1Q5JU00 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCTE1Q5JU00 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TCTE1Q5JU00 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCTE1Q5JU00 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCTE1Q5JU00 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TCTE1Q5JU00 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCTE1Q5JU00 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCTE1Q5JU00 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCTE1Q5JU00 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCTE1Q5JU00 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCTE1Q5JU00 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCTE1Q5JU00 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TCTE1Q5JU00 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCTE1Q5JU00 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCTE1Q5JU00 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCTE1Q5JU00 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TCTE1Q5JU00 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCTE1Q5JU00 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TCTE1Q5JU00 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCTE1Q5JU00 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCTE1Q5JU00 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TCTE1Q5JU00 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TCTE1Q5JU00 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TCTE1Q5JU00 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCTE1Q5JU00 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCTE1Q5JU00 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TCTE1Q5JU00 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCTE1Q5JU00 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCTE1Q5JU00 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCTE1Q5JU00 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCTE1Q5JU00 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TCTE1Q5JU00 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TCTE1Q5JU00 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCTE1Q5JU00 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCTE1Q5JU00 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TCTE1Q5JU00 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCTE1Q5JU00 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCTE1Q5JU00 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCTE1Q5JU00 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCTE1Q5JU00 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TCTE1Q5JU00 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TCTE1Q5JU00 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms