Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BRDTQ58F21 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
BRDTQ58F21 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRDTQ58F21 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRDTQ58F21 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
BRDTQ58F21 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRDTQ58F21 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRDTQ58F21 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRDTQ58F21 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRDTQ58F21 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
BRDTQ58F21 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRDTQ58F21 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRDTQ58F21 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
BRDTQ58F21 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRDTQ58F21 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRDTQ58F21 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRDTQ58F21 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
BRDTQ58F21 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRDTQ58F21 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRDTQ58F21 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
BRDTQ58F21 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRDTQ58F21 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
BRDTQ58F21 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRDTQ58F21 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
BRDTQ58F21 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
BRDTQ58F21 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRDTQ58F21 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRDTQ58F21 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
BRDTQ58F21 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRDTQ58F21 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRDTQ58F21 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
BRDTQ58F21 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
BRDTQ58F21 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
BRDTQ58F21 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
BRDTQ58F21 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
BRDTQ58F21 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRDTQ58F21 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRDTQ58F21 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRDTQ58F21 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRDTQ58F21 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
BRDTQ58F21 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRDTQ58F21 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRDTQ58F21 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRDTQ58F21 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
BRDTQ58F21 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
BRDTQ58F21 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRDTQ58F21 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
BRDTQ58F21 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRDTQ58F21 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
BRDTQ58F21 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRDTQ58F21 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRDTQ58F21 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRDTQ58F21 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
BRDTQ58F21 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRDTQ58F21 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRDTQ58F21 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRDTQ58F21 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRDTQ58F21 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRDTQ58F21 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
BRDTQ58F21 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRDTQ58F21 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRDTQ58F21 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
BRDTQ58F21 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRDTQ58F21 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRDTQ58F21 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRDTQ58F21 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRDTQ58F21 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRDTQ58F21 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
BRDTQ58F21 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRDTQ58F21 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
BRDTQ58F21 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
BRDTQ58F21 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
BRDTQ58F21 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRDTQ58F21 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRDTQ58F21 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRDTQ58F21 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
BRDTQ58F21 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRDTQ58F21 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
BRDTQ58F21 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRDTQ58F21 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
BRDTQ58F21 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRDTQ58F21 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRDTQ58F21 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRDTQ58F21 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
BRDTQ58F21 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
BRDTQ58F21 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRDTQ58F21 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRDTQ58F21 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRDTQ58F21 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRDTQ58F21 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRDTQ58F21 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
BRDTQ58F21 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRDTQ58F21 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRDTQ58F21 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRDTQ58F21 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
BRDTQ58F21 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRDTQ58F21 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
BRDTQ58F21 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRDTQ58F21 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
BRDTQ58F21 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms