Protein–RNA interactions for Protein: Q53H64

LINC00483, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00483, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00483Q53H64 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00483Q53H64 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00483Q53H64 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00483Q53H64 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00483Q53H64 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00483Q53H64 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LINC00483Q53H64 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00483Q53H64 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00483Q53H64 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00483Q53H64 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00483Q53H64 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
LINC00483Q53H64 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00483Q53H64 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00483Q53H64 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00483Q53H64 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00483Q53H64 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00483Q53H64 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
LINC00483Q53H64 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
LINC00483Q53H64 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00483Q53H64 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00483Q53H64 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
LINC00483Q53H64 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00483Q53H64 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00483Q53H64 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00483Q53H64 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00483Q53H64 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00483Q53H64 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00483Q53H64 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
LINC00483Q53H64 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00483Q53H64 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00483Q53H64 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00483Q53H64 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00483Q53H64 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LINC00483Q53H64 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00483Q53H64 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00483Q53H64 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00483Q53H64 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00483Q53H64 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00483Q53H64 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00483Q53H64 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00483Q53H64 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LINC00483Q53H64 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00483Q53H64 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00483Q53H64 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00483Q53H64 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00483Q53H64 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00483Q53H64 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00483Q53H64 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00483Q53H64 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00483Q53H64 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00483Q53H64 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00483Q53H64 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00483Q53H64 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms