Protein–RNA interactions for Protein: Q53GA4

PHLDA2, Pleckstrin homology-like domain family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA2Q53GA4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHLDA2Q53GA4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHLDA2Q53GA4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PHLDA2Q53GA4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHLDA2Q53GA4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHLDA2Q53GA4 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHLDA2Q53GA4 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PHLDA2Q53GA4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHLDA2Q53GA4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHLDA2Q53GA4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHLDA2Q53GA4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHLDA2Q53GA4 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHLDA2Q53GA4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHLDA2Q53GA4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHLDA2Q53GA4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHLDA2Q53GA4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PHLDA2Q53GA4 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHLDA2Q53GA4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHLDA2Q53GA4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PHLDA2Q53GA4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PHLDA2Q53GA4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PHLDA2Q53GA4 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PHLDA2Q53GA4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
PHLDA2Q53GA4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PHLDA2Q53GA4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PHLDA2Q53GA4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PHLDA2Q53GA4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PHLDA2Q53GA4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PHLDA2Q53GA4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PHLDA2Q53GA4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PHLDA2Q53GA4 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PHLDA2Q53GA4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PHLDA2Q53GA4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PHLDA2Q53GA4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PHLDA2Q53GA4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PHLDA2Q53GA4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PHLDA2Q53GA4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PHLDA2Q53GA4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHLDA2Q53GA4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHLDA2Q53GA4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHLDA2Q53GA4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHLDA2Q53GA4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PHLDA2Q53GA4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PHLDA2Q53GA4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PHLDA2Q53GA4 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PHLDA2Q53GA4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHLDA2Q53GA4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHLDA2Q53GA4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHLDA2Q53GA4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHLDA2Q53GA4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
PHLDA2Q53GA4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHLDA2Q53GA4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHLDA2Q53GA4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHLDA2Q53GA4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHLDA2Q53GA4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
PHLDA2Q53GA4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
PHLDA2Q53GA4 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHLDA2Q53GA4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHLDA2Q53GA4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
PHLDA2Q53GA4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHLDA2Q53GA4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHLDA2Q53GA4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
PHLDA2Q53GA4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHLDA2Q53GA4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHLDA2Q53GA4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHLDA2Q53GA4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
PHLDA2Q53GA4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PHLDA2Q53GA4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PHLDA2Q53GA4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PHLDA2Q53GA4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
PHLDA2Q53GA4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHLDA2Q53GA4 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHLDA2Q53GA4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
PHLDA2Q53GA4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PHLDA2Q53GA4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PHLDA2Q53GA4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHLDA2Q53GA4 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHLDA2Q53GA4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHLDA2Q53GA4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PHLDA2Q53GA4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHLDA2Q53GA4 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHLDA2Q53GA4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PHLDA2Q53GA4 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHLDA2Q53GA4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHLDA2Q53GA4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PHLDA2Q53GA4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHLDA2Q53GA4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHLDA2Q53GA4 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHLDA2Q53GA4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
PHLDA2Q53GA4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHLDA2Q53GA4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PHLDA2Q53GA4 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHLDA2Q53GA4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHLDA2Q53GA4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHLDA2Q53GA4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHLDA2Q53GA4 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PHLDA2Q53GA4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHLDA2Q53GA4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHLDA2Q53GA4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
PHLDA2Q53GA4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms