Protein–RNA interactions for Protein: Q52LA3

LIN52, Protein lin-52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN52Q52LA3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIN52Q52LA3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LIN52Q52LA3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIN52Q52LA3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIN52Q52LA3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIN52Q52LA3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LIN52Q52LA3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIN52Q52LA3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIN52Q52LA3 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIN52Q52LA3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIN52Q52LA3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LIN52Q52LA3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LIN52Q52LA3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIN52Q52LA3 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
LIN52Q52LA3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
LIN52Q52LA3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
LIN52Q52LA3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
LIN52Q52LA3 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIN52Q52LA3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
LIN52Q52LA3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIN52Q52LA3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIN52Q52LA3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
LIN52Q52LA3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN52Q52LA3 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
LIN52Q52LA3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIN52Q52LA3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIN52Q52LA3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
LIN52Q52LA3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIN52Q52LA3 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIN52Q52LA3 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
LIN52Q52LA3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIN52Q52LA3 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
LIN52Q52LA3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIN52Q52LA3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIN52Q52LA3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
LIN52Q52LA3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIN52Q52LA3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIN52Q52LA3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIN52Q52LA3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIN52Q52LA3 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
LIN52Q52LA3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIN52Q52LA3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIN52Q52LA3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIN52Q52LA3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
LIN52Q52LA3 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LIN52Q52LA3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIN52Q52LA3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
LIN52Q52LA3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
LIN52Q52LA3 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIN52Q52LA3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIN52Q52LA3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIN52Q52LA3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIN52Q52LA3 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIN52Q52LA3 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIN52Q52LA3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIN52Q52LA3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
LIN52Q52LA3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN52Q52LA3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN52Q52LA3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN52Q52LA3 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN52Q52LA3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN52Q52LA3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
LIN52Q52LA3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIN52Q52LA3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIN52Q52LA3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LIN52Q52LA3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIN52Q52LA3 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIN52Q52LA3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LIN52Q52LA3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LIN52Q52LA3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIN52Q52LA3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIN52Q52LA3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LIN52Q52LA3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIN52Q52LA3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIN52Q52LA3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIN52Q52LA3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIN52Q52LA3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIN52Q52LA3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIN52Q52LA3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIN52Q52LA3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LIN52Q52LA3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
LIN52Q52LA3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIN52Q52LA3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIN52Q52LA3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LIN52Q52LA3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN52Q52LA3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN52Q52LA3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN52Q52LA3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
LIN52Q52LA3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LIN52Q52LA3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIN52Q52LA3 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIN52Q52LA3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIN52Q52LA3 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIN52Q52LA3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LIN52Q52LA3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LIN52Q52LA3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
LIN52Q52LA3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LIN52Q52LA3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LIN52Q52LA3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
LIN52Q52LA3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms