Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BBS9Q3SYG4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BBS9Q3SYG4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
BBS9Q3SYG4 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BBS9Q3SYG4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BBS9Q3SYG4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BBS9Q3SYG4 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BBS9Q3SYG4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
BBS9Q3SYG4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
BBS9Q3SYG4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BBS9Q3SYG4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
BBS9Q3SYG4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBS9Q3SYG4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBS9Q3SYG4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBS9Q3SYG4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBS9Q3SYG4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBS9Q3SYG4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBS9Q3SYG4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
BBS9Q3SYG4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
BBS9Q3SYG4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
BBS9Q3SYG4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BBS9Q3SYG4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
BBS9Q3SYG4 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
BBS9Q3SYG4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BBS9Q3SYG4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
BBS9Q3SYG4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BBS9Q3SYG4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
BBS9Q3SYG4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BBS9Q3SYG4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BBS9Q3SYG4 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
BBS9Q3SYG4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BBS9Q3SYG4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
BBS9Q3SYG4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
BBS9Q3SYG4 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
BBS9Q3SYG4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BBS9Q3SYG4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BBS9Q3SYG4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
BBS9Q3SYG4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
BBS9Q3SYG4 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BBS9Q3SYG4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BBS9Q3SYG4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BBS9Q3SYG4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
BBS9Q3SYG4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
BBS9Q3SYG4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BBS9Q3SYG4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BBS9Q3SYG4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BBS9Q3SYG4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
BBS9Q3SYG4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
BBS9Q3SYG4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BBS9Q3SYG4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BBS9Q3SYG4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BBS9Q3SYG4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
BBS9Q3SYG4 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BBS9Q3SYG4 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BBS9Q3SYG4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
BBS9Q3SYG4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
BBS9Q3SYG4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
BBS9Q3SYG4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BBS9Q3SYG4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
BBS9Q3SYG4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
BBS9Q3SYG4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
BBS9Q3SYG4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BBS9Q3SYG4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BBS9Q3SYG4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
BBS9Q3SYG4 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BBS9Q3SYG4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
BBS9Q3SYG4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BBS9Q3SYG4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
BBS9Q3SYG4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BBS9Q3SYG4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
BBS9Q3SYG4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
BBS9Q3SYG4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BBS9Q3SYG4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BBS9Q3SYG4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BBS9Q3SYG4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
BBS9Q3SYG4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
BBS9Q3SYG4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
BBS9Q3SYG4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
BBS9Q3SYG4 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
BBS9Q3SYG4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
BBS9Q3SYG4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
BBS9Q3SYG4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
BBS9Q3SYG4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
BBS9Q3SYG4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BBS9Q3SYG4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
BBS9Q3SYG4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BBS9Q3SYG4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BBS9Q3SYG4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BBS9Q3SYG4 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
BBS9Q3SYG4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
BBS9Q3SYG4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
BBS9Q3SYG4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BBS9Q3SYG4 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BBS9Q3SYG4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
BBS9Q3SYG4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
BBS9Q3SYG4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BBS9Q3SYG4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
BBS9Q3SYG4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BBS9Q3SYG4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
BBS9Q3SYG4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms