Protein–RNA interactions for Protein: Q2YD98

UVSSA, UV-stimulated scaffold protein A, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UVSSAQ2YD98 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
UVSSAQ2YD98 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UVSSAQ2YD98 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
UVSSAQ2YD98 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
UVSSAQ2YD98 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
UVSSAQ2YD98 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
UVSSAQ2YD98 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
UVSSAQ2YD98 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UVSSAQ2YD98 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UVSSAQ2YD98 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
UVSSAQ2YD98 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UVSSAQ2YD98 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
UVSSAQ2YD98 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UVSSAQ2YD98 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
UVSSAQ2YD98 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
UVSSAQ2YD98 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
UVSSAQ2YD98 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UVSSAQ2YD98 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UVSSAQ2YD98 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UVSSAQ2YD98 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UVSSAQ2YD98 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UVSSAQ2YD98 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UVSSAQ2YD98 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UVSSAQ2YD98 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UVSSAQ2YD98 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UVSSAQ2YD98 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UVSSAQ2YD98 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
UVSSAQ2YD98 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UVSSAQ2YD98 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
UVSSAQ2YD98 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
UVSSAQ2YD98 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UVSSAQ2YD98 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UVSSAQ2YD98 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
UVSSAQ2YD98 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
UVSSAQ2YD98 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UVSSAQ2YD98 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
UVSSAQ2YD98 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
UVSSAQ2YD98 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
UVSSAQ2YD98 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UVSSAQ2YD98 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UVSSAQ2YD98 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UVSSAQ2YD98 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
UVSSAQ2YD98 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
UVSSAQ2YD98 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
UVSSAQ2YD98 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UVSSAQ2YD98 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UVSSAQ2YD98 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UVSSAQ2YD98 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UVSSAQ2YD98 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UVSSAQ2YD98 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
UVSSAQ2YD98 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UVSSAQ2YD98 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UVSSAQ2YD98 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
UVSSAQ2YD98 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
UVSSAQ2YD98 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UVSSAQ2YD98 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
UVSSAQ2YD98 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UVSSAQ2YD98 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UVSSAQ2YD98 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UVSSAQ2YD98 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
UVSSAQ2YD98 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
UVSSAQ2YD98 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
UVSSAQ2YD98 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
UVSSAQ2YD98 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
UVSSAQ2YD98 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
UVSSAQ2YD98 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
UVSSAQ2YD98 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
UVSSAQ2YD98 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UVSSAQ2YD98 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
UVSSAQ2YD98 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
UVSSAQ2YD98 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UVSSAQ2YD98 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
UVSSAQ2YD98 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UVSSAQ2YD98 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
UVSSAQ2YD98 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
UVSSAQ2YD98 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UVSSAQ2YD98 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UVSSAQ2YD98 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UVSSAQ2YD98 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
UVSSAQ2YD98 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UVSSAQ2YD98 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UVSSAQ2YD98 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UVSSAQ2YD98 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
UVSSAQ2YD98 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
UVSSAQ2YD98 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
UVSSAQ2YD98 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
UVSSAQ2YD98 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
UVSSAQ2YD98 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
UVSSAQ2YD98 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
UVSSAQ2YD98 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
UVSSAQ2YD98 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
UVSSAQ2YD98 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
UVSSAQ2YD98 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
UVSSAQ2YD98 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
UVSSAQ2YD98 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
UVSSAQ2YD98 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
UVSSAQ2YD98 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UVSSAQ2YD98 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
UVSSAQ2YD98 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
UVSSAQ2YD98 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.4 ms