Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
SPHKAPQ2M3C7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC37.31■■■■□ 3.56
SPHKAPQ2M3C7 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
SPHKAPQ2M3C7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
SPHKAPQ2M3C7 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
SPHKAPQ2M3C7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SPHKAPQ2M3C7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SPHKAPQ2M3C7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC37.3■■■■□ 3.56
SPHKAPQ2M3C7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SPHKAPQ2M3C7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC37.3■■■■□ 3.56
SPHKAPQ2M3C7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
SPHKAPQ2M3C7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
SPHKAPQ2M3C7 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
SPHKAPQ2M3C7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
SPHKAPQ2M3C7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SPHKAPQ2M3C7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
SPHKAPQ2M3C7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
SPHKAPQ2M3C7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
SPHKAPQ2M3C7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
SPHKAPQ2M3C7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SPHKAPQ2M3C7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
SPHKAPQ2M3C7 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
SPHKAPQ2M3C7 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SPHKAPQ2M3C7 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.23■■■■□ 3.55
SPHKAPQ2M3C7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
SPHKAPQ2M3C7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
SPHKAPQ2M3C7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC37.22■■■■□ 3.55
SPHKAPQ2M3C7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC37.22■■■■□ 3.55
SPHKAPQ2M3C7 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
SPHKAPQ2M3C7 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SPHKAPQ2M3C7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
SPHKAPQ2M3C7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC37.21■■■■□ 3.55
SPHKAPQ2M3C7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
SPHKAPQ2M3C7 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SPHKAPQ2M3C7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
SPHKAPQ2M3C7 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
SPHKAPQ2M3C7 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC37.19■■■■□ 3.54
SPHKAPQ2M3C7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SPHKAPQ2M3C7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SPHKAPQ2M3C7 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SPHKAPQ2M3C7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SPHKAPQ2M3C7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC37.18■■■■□ 3.54
SPHKAPQ2M3C7 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
SPHKAPQ2M3C7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC37.17■■■■□ 3.54
SPHKAPQ2M3C7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
SPHKAPQ2M3C7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
SPHKAPQ2M3C7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC37.16■■■■□ 3.54
SPHKAPQ2M3C7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC37.15■■■■□ 3.54
SPHKAPQ2M3C7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC37.15■■■■□ 3.54
SPHKAPQ2M3C7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
SPHKAPQ2M3C7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
SPHKAPQ2M3C7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SPHKAPQ2M3C7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SPHKAPQ2M3C7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
SPHKAPQ2M3C7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
SPHKAPQ2M3C7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC37.11■■■■□ 3.53
SPHKAPQ2M3C7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.11■■■■□ 3.53
SPHKAPQ2M3C7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SPHKAPQ2M3C7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
SPHKAPQ2M3C7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
SPHKAPQ2M3C7 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC37.09■■■■□ 3.53
SPHKAPQ2M3C7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SPHKAPQ2M3C7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
SPHKAPQ2M3C7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
SPHKAPQ2M3C7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC37.07■■■■□ 3.52
SPHKAPQ2M3C7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
SPHKAPQ2M3C7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
SPHKAPQ2M3C7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC37.07■■■■□ 3.52
SPHKAPQ2M3C7 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SPHKAPQ2M3C7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC37.06■■■■□ 3.52
SPHKAPQ2M3C7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SPHKAPQ2M3C7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
SPHKAPQ2M3C7 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC37.04■■■■□ 3.52
SPHKAPQ2M3C7 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
SPHKAPQ2M3C7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
SPHKAPQ2M3C7 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
SPHKAPQ2M3C7 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC37.01■■■■□ 3.51
SPHKAPQ2M3C7 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
SPHKAPQ2M3C7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC37■■■■□ 3.51
SPHKAPQ2M3C7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SPHKAPQ2M3C7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SPHKAPQ2M3C7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
SPHKAPQ2M3C7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.99■■■■□ 3.51
SPHKAPQ2M3C7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SPHKAPQ2M3C7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
SPHKAPQ2M3C7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
SPHKAPQ2M3C7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.98■■■■□ 3.51
SPHKAPQ2M3C7 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
SPHKAPQ2M3C7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC36.98■■■■□ 3.51
SPHKAPQ2M3C7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
SPHKAPQ2M3C7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
SPHKAPQ2M3C7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.97■■■■□ 3.51
SPHKAPQ2M3C7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
SPHKAPQ2M3C7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
SPHKAPQ2M3C7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC36.96■■■■□ 3.51
SPHKAPQ2M3C7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
SPHKAPQ2M3C7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC36.95■■■■□ 3.51
SPHKAPQ2M3C7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
SPHKAPQ2M3C7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC36.94■■■■□ 3.5
SPHKAPQ2M3C7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms