Protein–RNA interactions for Protein: Q16849

PTPRN, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, humanhuman

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Length 979 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRNQ16849 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTPRNQ16849 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRNQ16849 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRNQ16849 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRNQ16849 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRNQ16849 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTPRNQ16849 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRNQ16849 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRNQ16849 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTPRNQ16849 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRNQ16849 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRNQ16849 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTPRNQ16849 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRNQ16849 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRNQ16849 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRNQ16849 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRNQ16849 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRNQ16849 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRNQ16849 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTPRNQ16849 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRNQ16849 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTPRNQ16849 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRNQ16849 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRNQ16849 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRNQ16849 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRNQ16849 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTPRNQ16849 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRNQ16849 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRNQ16849 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRNQ16849 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRNQ16849 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PTPRNQ16849 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRNQ16849 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRNQ16849 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRNQ16849 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRNQ16849 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PTPRNQ16849 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRNQ16849 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRNQ16849 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRNQ16849 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRNQ16849 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PTPRNQ16849 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRNQ16849 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRNQ16849 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRNQ16849 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRNQ16849 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRNQ16849 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRNQ16849 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRNQ16849 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PTPRNQ16849 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRNQ16849 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRNQ16849 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRNQ16849 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRNQ16849 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRNQ16849 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PTPRNQ16849 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRNQ16849 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PTPRNQ16849 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRNQ16849 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRNQ16849 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRNQ16849 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRNQ16849 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRNQ16849 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRNQ16849 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PTPRNQ16849 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRNQ16849 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRNQ16849 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PTPRNQ16849 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRNQ16849 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRNQ16849 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRNQ16849 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRNQ16849 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PTPRNQ16849 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRNQ16849 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRNQ16849 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PTPRNQ16849 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRNQ16849 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRNQ16849 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRNQ16849 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRNQ16849 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRNQ16849 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRNQ16849 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRNQ16849 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRNQ16849 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRNQ16849 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PTPRNQ16849 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRNQ16849 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRNQ16849 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
PTPRNQ16849 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRNQ16849 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRNQ16849 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRNQ16849 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRNQ16849 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRNQ16849 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRNQ16849 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRNQ16849 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PTPRNQ16849 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PTPRNQ16849 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRNQ16849 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PTPRNQ16849 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
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