Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

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Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
FXNQ16595 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FXNQ16595 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FXNQ16595 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FXNQ16595 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
FXNQ16595 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FXNQ16595 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FXNQ16595 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FXNQ16595 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FXNQ16595 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FXNQ16595 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FXNQ16595 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FXNQ16595 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FXNQ16595 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FXNQ16595 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
FXNQ16595 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FXNQ16595 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
FXNQ16595 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FXNQ16595 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
FXNQ16595 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FXNQ16595 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FXNQ16595 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FXNQ16595 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FXNQ16595 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FXNQ16595 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FXNQ16595 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FXNQ16595 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FXNQ16595 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
FXNQ16595 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FXNQ16595 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
FXNQ16595 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FXNQ16595 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FXNQ16595 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FXNQ16595 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FXNQ16595 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FXNQ16595 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FXNQ16595 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FXNQ16595 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FXNQ16595 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FXNQ16595 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FXNQ16595 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FXNQ16595 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FXNQ16595 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FXNQ16595 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FXNQ16595 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FXNQ16595 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FXNQ16595 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FXNQ16595 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
FXNQ16595 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FXNQ16595 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FXNQ16595 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FXNQ16595 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FXNQ16595 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FXNQ16595 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FXNQ16595 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FXNQ16595 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FXNQ16595 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FXNQ16595 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FXNQ16595 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FXNQ16595 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FXNQ16595 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FXNQ16595 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FXNQ16595 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
FXNQ16595 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
FXNQ16595 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FXNQ16595 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FXNQ16595 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FXNQ16595 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FXNQ16595 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FXNQ16595 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FXNQ16595 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FXNQ16595 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
FXNQ16595 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FXNQ16595 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
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FXNQ16595 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FXNQ16595 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
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FXNQ16595 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FXNQ16595 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FXNQ16595 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FXNQ16595 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FXNQ16595 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FXNQ16595 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FXNQ16595 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FXNQ16595 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FXNQ16595 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FXNQ16595 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FXNQ16595 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FXNQ16595 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FXNQ16595 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FXNQ16595 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FXNQ16595 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FXNQ16595 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FXNQ16595 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FXNQ16595 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FXNQ16595 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FXNQ16595 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FXNQ16595 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
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