Protein–RNA interactions for Protein: Q16558

KCNMB1, Calcium-activated potassium channel subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB1Q16558 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNMB1Q16558 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNMB1Q16558 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNMB1Q16558 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNMB1Q16558 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNMB1Q16558 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNMB1Q16558 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNMB1Q16558 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNMB1Q16558 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMB1Q16558 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMB1Q16558 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMB1Q16558 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMB1Q16558 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMB1Q16558 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMB1Q16558 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMB1Q16558 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNMB1Q16558 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMB1Q16558 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMB1Q16558 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMB1Q16558 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMB1Q16558 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
KCNMB1Q16558 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMB1Q16558 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMB1Q16558 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNMB1Q16558 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNMB1Q16558 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNMB1Q16558 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNMB1Q16558 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNMB1Q16558 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNMB1Q16558 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNMB1Q16558 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNMB1Q16558 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNMB1Q16558 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNMB1Q16558 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNMB1Q16558 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNMB1Q16558 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNMB1Q16558 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNMB1Q16558 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNMB1Q16558 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNMB1Q16558 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNMB1Q16558 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNMB1Q16558 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNMB1Q16558 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNMB1Q16558 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNMB1Q16558 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNMB1Q16558 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNMB1Q16558 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNMB1Q16558 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNMB1Q16558 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMB1Q16558 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMB1Q16558 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMB1Q16558 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMB1Q16558 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMB1Q16558 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMB1Q16558 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMB1Q16558 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KCNMB1Q16558 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNMB1Q16558 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNMB1Q16558 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNMB1Q16558 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
KCNMB1Q16558 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
KCNMB1Q16558 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
KCNMB1Q16558 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMB1Q16558 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMB1Q16558 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMB1Q16558 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMB1Q16558 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMB1Q16558 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMB1Q16558 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
KCNMB1Q16558 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMB1Q16558 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMB1Q16558 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMB1Q16558 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMB1Q16558 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
KCNMB1Q16558 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMB1Q16558 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMB1Q16558 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMB1Q16558 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
KCNMB1Q16558 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMB1Q16558 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMB1Q16558 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMB1Q16558 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMB1Q16558 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMB1Q16558 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMB1Q16558 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
KCNMB1Q16558 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMB1Q16558 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMB1Q16558 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMB1Q16558 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMB1Q16558 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
KCNMB1Q16558 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
KCNMB1Q16558 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNMB1Q16558 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNMB1Q16558 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
KCNMB1Q16558 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB1Q16558 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB1Q16558 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB1Q16558 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB1Q16558 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
KCNMB1Q16558 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 175.7 ms