Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC1A5Q15758 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC1A5Q15758 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC1A5Q15758 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC1A5Q15758 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC1A5Q15758 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC1A5Q15758 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC1A5Q15758 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC1A5Q15758 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC1A5Q15758 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC1A5Q15758 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC1A5Q15758 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC1A5Q15758 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC1A5Q15758 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC1A5Q15758 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC1A5Q15758 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC1A5Q15758 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC1A5Q15758 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC1A5Q15758 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC1A5Q15758 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC1A5Q15758 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC1A5Q15758 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC1A5Q15758 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC1A5Q15758 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC1A5Q15758 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC1A5Q15758 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC1A5Q15758 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC1A5Q15758 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A5Q15758 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A5Q15758 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A5Q15758 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SLC1A5Q15758 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC1A5Q15758 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC1A5Q15758 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC1A5Q15758 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC1A5Q15758 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC1A5Q15758 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
SLC1A5Q15758 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC1A5Q15758 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC1A5Q15758 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC1A5Q15758 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SLC1A5Q15758 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC1A5Q15758 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC1A5Q15758 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC1A5Q15758 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC1A5Q15758 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC1A5Q15758 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SLC1A5Q15758 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC1A5Q15758 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SLC1A5Q15758 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC1A5Q15758 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC1A5Q15758 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC1A5Q15758 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC1A5Q15758 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SLC1A5Q15758 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC1A5Q15758 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC1A5Q15758 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC1A5Q15758 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC1A5Q15758 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SLC1A5Q15758 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms