Protein–RNA interactions for Protein: Q15599

SLC9A3R2, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF2, humanhuman

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Length 337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3R2Q15599 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A3R2Q15599 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A3R2Q15599 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A3R2Q15599 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A3R2Q15599 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A3R2Q15599 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A3R2Q15599 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A3R2Q15599 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A3R2Q15599 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A3R2Q15599 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A3R2Q15599 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A3R2Q15599 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A3R2Q15599 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A3R2Q15599 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A3R2Q15599 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A3R2Q15599 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A3R2Q15599 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A3R2Q15599 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A3R2Q15599 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A3R2Q15599 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A3R2Q15599 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A3R2Q15599 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A3R2Q15599 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC9A3R2Q15599 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A3R2Q15599 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A3R2Q15599 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A3R2Q15599 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A3R2Q15599 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A3R2Q15599 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A3R2Q15599 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A3R2Q15599 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A3R2Q15599 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A3R2Q15599 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A3R2Q15599 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A3R2Q15599 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A3R2Q15599 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A3R2Q15599 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A3R2Q15599 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A3R2Q15599 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A3R2Q15599 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SLC9A3R2Q15599 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A3R2Q15599 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A3R2Q15599 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A3R2Q15599 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A3R2Q15599 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A3R2Q15599 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SLC9A3R2Q15599 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A3R2Q15599 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A3R2Q15599 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SLC9A3R2Q15599 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A3R2Q15599 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A3R2Q15599 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A3R2Q15599 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A3R2Q15599 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A3R2Q15599 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SLC9A3R2Q15599 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC9A3R2Q15599 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC9A3R2Q15599 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A3R2Q15599 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A3R2Q15599 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A3R2Q15599 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC9A3R2Q15599 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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